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Enregistrement W1997718533 · doi:10.1074/jbc.m109.061622

GREBP, a cGMP-response Element-binding Protein Repressing the Transcription of Natriuretic Peptide Receptor 1 (NPR1/GCA)

2010· article· en· W1997718533 sur OpenAlexafffund
Guy Martel, Pavel Hamet, Johanne Tremblay

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyNPR1Chromatin immunoprecipitationMolecular biologyLuciferaseNPR2Atrial natriuretic peptideTranscription (linguistics)SOX4Gene expressionPromoterGeneNatriuretic peptideBiochemistryTransfectionInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NPR1/GCA (natriuretic peptide receptor 1/guanylyl cyclase A) expression is controlled by several agents, including ANP (atrial natriuretic peptide). After ANP stimulation, NPR1/GCA down-regulates the transcriptional activity of its gene via a cGMP-dependent mechanism. Because we previously identified a cis-acting element responsible for this cGMP sensitivity, we proceed here to explore novel putative protein binding to cGMP-response element (cGMP-RE). Using the yeast one-hybrid technique with a human kidney cDNA library, we identified a strong positive clone able to bind cGMP-RE. The clone was derived from 1083-bp-long cDNA of a gene of yet unknown function localized on human chromosome 1 (1p33.36). We named this new protein GREBP (for cGMP-response element-binding protein). DNA binding assays showed 18-fold higher cGMP-RE binding capacity than the controls, whereas an electromobility shift assay indicated a specific binding for the cGMP-RE, and chromatin immunoprecipitation confirmed the binding of GREBP to the element under physiological conditions. By acting on cGMP-RE, GREBP inhibited the expression of a luciferase-coupled NPR1 promoter construct. In H295R cells, ANP heightened GREBP expression by 60% after just 3 h of treatment while inhibiting NPR1/GCA expression by 30%. Silencing GREBP with specific small interfering RNA increased the activity of the luciferase-coupled NPR1 promoter and GCA/NPR1 mRNA levels. GREBP is a nuclear protein mainly expressed in the heart. We report here the existence of a human-specific gene that acts as a transcriptional repressor of the NPR1/GCA gene. NPR1/GCA (natriuretic peptide receptor 1/guanylyl cyclase A) expression is controlled by several agents, including ANP (atrial natriuretic peptide). After ANP stimulation, NPR1/GCA down-regulates the transcriptional activity of its gene via a cGMP-dependent mechanism. Because we previously identified a cis-acting element responsible for this cGMP sensitivity, we proceed here to explore novel putative protein binding to cGMP-response element (cGMP-RE). Using the yeast one-hybrid technique with a human kidney cDNA library, we identified a strong positive clone able to bind cGMP-RE. The clone was derived from 1083-bp-long cDNA of a gene of yet unknown function localized on human chromosome 1 (1p33.36). We named this new protein GREBP (for cGMP-response element-binding protein). DNA binding assays showed 18-fold higher cGMP-RE binding capacity than the controls, whereas an electromobility shift assay indicated a specific binding for the cGMP-RE, and chromatin immunoprecipitation confirmed the binding of GREBP to the element under physiological conditions. By acting on cGMP-RE, GREBP inhibited the expression of a luciferase-coupled NPR1 promoter construct. In H295R cells, ANP heightened GREBP expression by 60% after just 3 h of treatment while inhibiting NPR1/GCA expression by 30%. Silencing GREBP with specific small interfering RNA increased the activity of the luciferase-coupled NPR1 promoter and GCA/NPR1 mRNA levels. GREBP is a nuclear protein mainly expressed in the heart. We report here the existence of a human-specific gene that acts as a transcriptional repressor of the NPR1/GCA gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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