Essential Gene Identification and Drug Target Prioritization in Aspergillus fumigatus
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Aspergillus fumigatus is the most prevalent airborne filamentous fungal pathogen in humans, causing severe and often fatal invasive infections in immunocompromised patients. Currently available antifungal drugs to treat invasive aspergillosis have limited modes of action, and few are safe and effective. To identify and prioritize antifungal drug targets, we have developed a conditional promoter replacement (CPR) strategy using the nitrogen-regulated A. fumigatus NiiA promoter (pNiiA). The gene essentiality for 35 A. fumigatus genes was directly demonstrated by this pNiiA-CPR strategy from a set of 54 genes representing broad biological functions whose orthologs are confirmed to be essential for growth in Candida albicans and Saccharomyces cerevisiae. Extending this approach, we show that the ERG11 gene family (ERG11A and ERG11B) is essential in A. fumigatus despite neither member being essential individually. In addition, we demonstrate the pNiiA-CPR strategy is suitable for in vivo phenotypic analyses, as a number of conditional mutants, including an ERG11 double mutant (erg11BDelta, pNiiA-ERG11A), failed to establish a terminal infection in an immunocompromised mouse model of systemic aspergillosis. Collectively, the pNiiA-CPR strategy enables a rapid and reliable means to directly identify, phenotypically characterize, and facilitate target-based whole cell assays to screen A. fumigatus essential genes for cognate antifungal inhibitors.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle