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Enregistrement W1997880464 · doi:10.1095/biolreprod.102.013045

Identification of Novel Isoforms of Activin Receptor-Like Kinase 7 (ALK7) Generated by Alternative Splicing and Expression of ALK7 and Its Ligand, Nodal, in Human Placenta1

2003· article· en· W1997880464 sur OpenAlexafffund
Heather Roberts, Siqin Hu, Qing Qiu, Peter C. K. Leung, Isabella Caniggia, Andrée Gruslin, Benjamin K. Tsang, Chun Peng

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of British ColumbiaUniversity of OttawaYork University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésBiologyAlternative splicingExonGene isoformACVR2BMolecular biologyGeneticsGeneReceptorTGF beta signaling pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the transforming growth factor (TGF) beta family play critical roles in regulating placental functions. Using polymerase chain reaction (PCR)-based strategies, we have cloned four transcripts encoding full-length activin receptor-like kinase 7 (ALK7) and three novel ALK7 isoforms from the human placenta. The full-length ALK7 has 493 amino acids and exhibits all characteristics of TGFbeta type I receptors, including an activin receptor-binding domain, a transmembrane domain, a GS domain, and a serine/threonine kinase domain. The three ALK7 isoforms identified include a truncated ALK7 (tALK7) and two soluble proteins designated as soluble ALK7a (sALK7a) and soluble ALK7b (sALK7b). The tALK7 lacks the first 50 amino acids of the full-length ALK7, resulting in a truncated receptor-binding domain. Both sALK7a and sALK7b lack transmembrane and GS domains. The ALK7 gene, located on chromosome 2q24.1, is composed of at least nine exons and eight introns. The isoforms of ALK7 are generated by alternative splicing. Transcripts encoding the sALK7 isoforms differ from the full-length transcript by lacking exon III or both exons III and IV in sALK7a and sALK7b, respectively. The transcript for tALK7 uses an alternative exon located within the first intron of the full-length transcript. These results indicate that four distinct proteins are encoded by the human ALK7 gene. Both reverse transcription-PCR and Western blot analysis showed that ALK7 and its isoforms are expressed in human placentae of different stages of pregnancy and that their expression is developmentally regulated. In addition, mRNA expression of Nodal, a ligand for ALK7, was also detected in placentae of different gestational age. The role of Nodal and ALK7 in human placenta is currently under investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,369

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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