Compositional Characterization of the Cytoskeleton of NK-Like Cells
Notice bibliographique
Résumé
The cytoskeleton is a dynamic structure that contributes to cell function in terms of shape, movement, transport and secretion. It also provides a platform for regional activities such as signaling, biosynthesis and energy production. The present manuscript describes a method for cytoskeleton isolation based on capture with magnetic microbeads and its application to the analysis of the NK like cell line, YTS. The isolated proteins were separated by SDS-PAGE and the peptides from the in gel digested proteins were analyzed by on line nano-LC-MSMS. Approximately 76% of the 126 isolated proteins were either components of the cytoskeleton or proteins that were known to be capable of associating with the cytoskeleton. The enrichment was confirmed by western blot for actin and alpha-actinin. The isolation was dependent on intact actin microfilaments as pretreatment of cells with cytochalasin D resulted in a marked reduction in the number of proteins isolated. The method allowed for the identification of several proteins that have not been previously described in lymphoid cells (EPLIN, SETA). A number of other scaffolding and lipid raft associated proteins were described suggesting a link between the cytoskeleton and these structures. The approach may have application to the proteomic examination of the cytoskeleton in a variety of cell types.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».