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Enregistrement W1998489965 · doi:10.1021/pr0502121

Compositional Characterization of the Cytoskeleton of NK-Like Cells

2005· article· en· W1998489965 sur OpenAlexaff
Xiaobo Meng, John A. Wilkins

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytoskeletonCell biologyActinActin cytoskeletonBiologyMicrofilamentSecretionChemistryCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cytoskeleton is a dynamic structure that contributes to cell function in terms of shape, movement, transport and secretion. It also provides a platform for regional activities such as signaling, biosynthesis and energy production. The present manuscript describes a method for cytoskeleton isolation based on capture with magnetic microbeads and its application to the analysis of the NK like cell line, YTS. The isolated proteins were separated by SDS-PAGE and the peptides from the in gel digested proteins were analyzed by on line nano-LC-MSMS. Approximately 76% of the 126 isolated proteins were either components of the cytoskeleton or proteins that were known to be capable of associating with the cytoskeleton. The enrichment was confirmed by western blot for actin and alpha-actinin. The isolation was dependent on intact actin microfilaments as pretreatment of cells with cytochalasin D resulted in a marked reduction in the number of proteins isolated. The method allowed for the identification of several proteins that have not been previously described in lymphoid cells (EPLIN, SETA). A number of other scaffolding and lipid raft associated proteins were described suggesting a link between the cytoskeleton and these structures. The approach may have application to the proteomic examination of the cytoskeleton in a variety of cell types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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