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Enregistrement W1999063456 · doi:10.1021/bi015538b

Independent Lec1A CHO Glycosylation Mutants Arise from Point Mutations in <i>N</i>-Acetylglucosaminyltransferase I That Reduce Affinity for Both Substrates. Molecular Consequences Based on the Crystal Structure of GlcNAc-TI<sup>,</sup>

2001· article· en· W1999063456 sur OpenAlexaff
Wei Chen, Uluğ M Ünligil, James M. Rini, Pamela Stanley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteU.S. Public Health Service
Mots-clésAsparagineMutantGlycosylationAmino acidGlycanBiochemistryMutagenesisChemistryN-linked glycosylationArgininePoint mutationChinese hamster ovary cellMutationSite-directed mutagenesisStereochemistryGlycoproteinGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A key enzyme in regulating the maturation of N-linked glycans is UDP-N-acetylglucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GlcNAc-TI, EC 2.4.1.101). Lec1 CHO cells lack GlcNAc-TI activity and synthesize only the oligomannosyl class of N-glycans. By contrast, Lec1A CHO mutants have weak GlcNAc-TI activity due to the reduced affinity of GlcNAc-TI for both the UDP-GlcNAc and Man(5)GlcNAc(2)Asn substrates. Lec1A CHO mutants synthesize hybrid and complex N-glycans, albeit in reduced amounts compared to parental CHO cells. In this paper, we identify two point mutations that gave rise to the Lec1A phenotype in three independent Lec1A CHO mutants. The G634A mutation in Lec1A.2C converts an aspartic acid to an asparagine at amino acid 212, disrupting a conserved DXD motif (E(211)DD(213) in all GlcNAc-TIs) that makes critical interactions with bound UDP-GlcNAc and Mn(2+) ion in rabbit GlcNAc-TI. The C907T mutation in Lec1A.3E and Lec1A.5J converts an arginine conserved in all GlcNAc-TIs to a tryptophan at amino acid 303, altering interactions that are important in stabilizing a critical structural element in rabbit GlcNAc-TI. Correction of each mutation by site-directed mutagenesis restored their GlcNAc-TI activity and lectin binding properties to parental levels. The effect of the two amino acid changes on GlcNAc-TI catalysis is discussed in relation to the crystal structure of rabbit GlcNAc-TI complexed with manganese and UDP-GlcNAc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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