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Enregistrement W1999799926 · doi:10.1021/ja073305n

Guest-Mediated Access to a Single DNA Nanostructure from a Library of Multiple Assemblies

2007· article· en· W1999799926 sur OpenAlexaff
Faisal A. Aldaye, Hanadi F. Sleiman

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryDNAVertex (graph theory)TemplateNanostructureMoleculeNanotechnologyCombinatorial chemistryCrystallographyTopology (electrical circuits)Computer scienceTheoretical computer scienceBiochemistryMaterials scienceCombinatoricsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present a method in which a small molecule template is used to access a single DNA nanostructure from a library of multiple assemblies. DNA building blocks 2 and 2 ‘, in which two identical DNA arms branch from a fully rigid organic vertex, were synthesized and their self-assembly was found to generate a small dynamic library of products. The small molecule Ru(bpy) 3 2+ was found to provide access to a single member from this library (i.e., square 5 ) and was also found to re-equilibrate each other already formed member into 5 quantitatively. The use of a small molecule to access a single DNA assembly from many possible combinations introduces an additional level of control in DNA construction. In addition, the ability of this template to transform the other members into the same single product provides a built-in correction mechanism that helps ensure the integrity of the construction process, even when “errors” are made. We apply this approach to predictably generate periodic 1D DNA fibers extending over tens of microns, using two trifunctional symmetrical DNA building blocks that otherwise assemble into ill-defined oligomeric networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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