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Enregistrement W2000270473 · doi:10.1074/jbc.m603930200

Identification of Two Domains Involved in the Assembly of Transient Receptor Potential Canonical Channels

2006· article· en· W2000270473 sur OpenAlexaff
Pascale K. Lepage, Marc Lussier, Héctor Barajas-Martínez, Simon M. Bousquet, Alexandre P. Blanchard, Nancy Francoeur, Robert Dumaine, Guylain Boulay

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTRPCTransient receptor potential channelTRPC6TRPC3SubfamilyTRPC1TRPC5Ankyrin repeatHEK 293 cellsCell biologyAnkyrinBiologyChimera (genetics)C-terminusN-terminusReceptorMolecular biologyBiophysicsBiochemistryPeptide sequenceAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transient receptor potential canonical (TRPC) channels are associated with calcium entry activity in nonexcitable cells. TRPCs can form homo- or heterotetrameric channels, in which case they can assemble together within a subfamily groups. TRPC1, 4, and 5 represent one group, and TRPC3, 6, and 7 represent the other. The molecular determinants involved in promoting subunit tetramerization are not known. To identify them, we generated chimeras by swapping the different domains of TRPC4 with the same regions in TRPC6. We showed that TRPC4 coimmunoprecipitated with the chimeras containing the ankyrin repeats and coiled-coil domains of TRPC4 into TRPC6. However, chimeras containing only the ankyrin repeats or only the coiled-coil domain of TRPC4 did not coimmunoprecipitate with TRPC4. We also showed that a second domain of interaction composed of the pore region and the C-terminal tail is involved in the oligomerization of TRPC4. However, chimeras containing only the pore region or only the C-terminal tail of TRPC4 did not coimmunoprecipitate with TRPC4. Furthermore, we showed that the N terminus of TRPC6 coimmunoprecipitated with the C terminus of TRPC6. Overexpression in HEK293T cells of chimeras that contained an N terminus and a C terminus from different subfamily groups increased intracellular calcium entry subsequent to stimulation of G(q) protein-coupled receptors. These results suggest that two types of interactions are involved in the assembly of the four subunits of the TRPC channel. The first interaction occurs between the N termini and involves two regions. The second interaction occurs between the N terminus and the C terminus and does not appear to be necessary for the activity of TRPCs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,234

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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