MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2000704978 · doi:10.1074/jbc.m110.152744

Alternatively Spliced Caspase-6B Isoform Inhibits the Activation of Caspase-6A

2010· article· en· W2000704978 sur OpenAlexafffund
Andrea W Lee, Nathalie Champagne, Xiaojun Wang, Xiao‐Dong Su, Cynthia G. Goodyer, Andréa C. LeBlanc

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCaspaseNLRP1Gene isoformBiologyCell biologyAlternative splicingMolecular biologyProgrammed cell deathGeneApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Caspase-6 (Casp6) is activated early in Alzheimer disease and involved in axonal degeneration, but the regulation of Casp6 activity has not been explored. Several alternatively spliced forms of caspases act as inhibitors of caspase activation. The CASP6 gene generates an alternatively spliced transcript known as CASP6β in addition to the CASP6α that encodes pro-Casp6a. Here, we show that the CASP6β transcript and the pro-Casp6b protein are present in many cell lines, in primary human neurons, and in human brains. Unlike most other alternatively spliced caspase transcripts, pro-Casp6b contains a catalytic site. However, purified pro-Casp6b did not have caspase activity, nor did it inhibit already activated Casp6a. Pro-Casp6b prevented the proteolytic activation of pro-Casp6a in vitro and in cells. Pro-Casp6b interacts directly with pro-Casp6a. This work shows that pro-Casp6b is an inhibitor of pro-Casp6a activation. These results imply that pro-Casp6b could negatively regulate pro-Casp6a activation in neurons and prevent Casp6a-mediated axonal degeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCell death mechanisms and regulationTravaux en français237 207