Antimicrobial Resistance and Virulence Factors <i>stx</i> 1, <i>stx</i> 2, and <i>eae</i> in Generic <i>Escherichia coli</i> Isolates from Calves in Western Canadian Cow-Calf Herds
Notice bibliographique
Résumé
The objective of this study was to evaluate the association between antimicrobial resistance (AMR) in 106 fecal generic Escherichia coli isolates from calves in cow-calf herds, based on either phenotype or the presence of resistance genes, and the occurrence of virulence factors stx1, stx2, and eae. Three virulence genes and 23 AMR genes for six antimicrobial families were examined using DNA hybridization and PCR. Antimicrobial susceptibility of the isolates was tested using microbroth dilution (Sensititre, TREK Diagnostic Systems, Cleveland, OH) and the 2002 National Antimicrobial Monitoring System (NARMS) panel. The 106 isolates examined in this study were a stratified random subset from a larger study of AMR in cow-calf herds; 88.7% of the selected isolates were resistant to at least one antimicrobial, and 89.6% of the selected isolates were positive for at least one resistance gene. At least one virulence factor was identified in 48.1% (95%CI, 37.7-58.7) of the isolates. The most common virulence gene detected was stx2 followed by eae. Neither AMR measured phenotypically nor the presence of AMR genes were associated with the presence of above Shiga-toxigenic E. coli virulence factors in this population of healthy beef calves.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».