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Enregistrement W2001042199 · doi:10.1021/cg700683a

Crystallogenesis Research for Biology in the Last Two Decades as Seen from the International Conferences on the Crystallization of Biological Macromolecules

2007· article· en· W2001042199 sur OpenAlexaboutno aff
Alexander McPherson, Richard Giegé

Notice bibliographique

RevueCrystal Growth & Design · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCentre National de la Recherche Scientifique
Mots-clésLimitingCrystallizationProtein crystallizationNanotechnologyMacromoleculeChemistryEngineering ethicsMaterials scienceEngineeringBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The series of 11 International Conferences on the Crystallization of Biological Macromolecules (ICCBM) took place over the period 1986–2006 in the USA (four times), Germany (two times), China, France, Japan, Spain, and lastly the 11th in Canada in Quebec City. Here we review the first 10 ICCBMs. Their focus was to bring rational approaches to the field of protein crystal growth and thus overcome the rate-limiting step in macromolecular X-ray crystallography. This survey summarizes how the ICCBM series contributed to the emergence of the science of biocrystallogenesis. This was achieved through the joint efforts of scientists from the small molecule crystal growth community and from biochemists, biophysicists, and protein crystallographers. Highlights from each conference are discussed, and scientific synergies are emphasized. While the first conferences focused on fundamentals, especially from the standpoint of physics and biochemical considerations, the more recent conferences stressed applications in structural biology, to advanced methods of crystallization, and of crystal quality improvement. Particular attention will be given to themes that were recurrent through all the ICCBMs: purity and impurities, solution properties of macromolecules under precrystallization conditions, microgravity and assessment of crystal quality, as well as specific trends of practical interest to structural biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0060,004
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,129
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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