The Conformational Origin of the Barrier to the Formation of Neighboring Group Assistance in Glycosylation Reactions: A Dynamical Density Functional Theory Study
Notice bibliographique
Résumé
Static and dynamical Density Functional Theory studies of 2,6-di-O-acetyl-3,4-O-isopropylidene-D-galactopyranosyl cation have shown that this cation can exist in two conformers characterized as (2)S(O) and B(2,5), respectively. The (2)S(O) conformer has the O-2 acyl group equatorial with the carbonyl syn to H-2 and is populated by monocyclic oxocarbenium ions. These conformational features are present in the structurally related glycosyl donor ethyl 2,6-di-O-benzoyl-3,4-O-isopropylidene-beta-D-galactothiopyranoside as determined by X-ray diffraction studies. The B(2,5) conformer has O-2 axial and allows the carbonyl to rotate and close the five-membered ring to form a bicyclic dioxolenium ion. Constraints based on natural internal coordinates were implemented to study this conformational transition. In this way the barrier to interconversion has been determined to be 34 kJ mol(-)(1) with a transition state characterized as (O)S(2) and a pathway involving pseudorotation. Thus, for the first time the structures and energetics of the key ions postulated to be involved in neighboring group assisted glycosylation reactions have been determined.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».