The <i>ARID1A</i> pathway in ovarian clear cell and endometrioid carcinoma, contiguous endometriosis, and benign endometriosis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To assess ARID1A-encoded protein (BAF250a) and phosphorylated AKT (pAKT) expression, apoptosis, and the DNA damage response pathway in endometrioid and clear cell ovarian cancers (endometriosis-associated ovarian cancers [EAOCs]), and benign endometriotic ovarian cysts. METHODS: In a retrospective study, tissue samples were reviewed from patients who had undergone surgery for EAOC or endometriotic ovarian cysts at a center in Montreal, QC, Canada, between 2000 and 2012. A tissue microarray including cases of endometrioid carcinoma, clear cell carcinoma, contiguous endometriosis (i.e. apparently benign endometriosis near the EAOC), and benign endometriotic ovarian cysts, was analyzed for the expression of various proteins. RESULTS: Loss of BAF250a expression was seen in 13 (22%) of 59 endometrioid cancers, 17 (47%) of 36 clear cell cases, 8 (44%) of 18 contiguous endometriosis cases, and 3 (8%) of 66 benign endometriotic ovarian cysts. In tissues showing loss of BAF250a, expression of pAKT, γH2AX, BIM, and BAX was higher in EAOC and contiguous endometriosis than in benign endometriosis (P<0.05), whereas expression of pATM, pCHK2, and Bcl2 was low. All proteins except for Bcl2 showed low expression in benign endometriosis. CONCLUSION: Loss of ARID1A-encoded protein seems to be an early event in EOAC, along with pAKT activation, alteration of γH2AX, and concomitant activation of the apoptosis pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».