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Enregistrement W2001874106 · doi:10.4161/pri.28939

Lipopolysaccharide induced conversion of recombinant prion protein

2014· article· en· W2001874106 sur OpenAlexafffund
Fozia Saleem, Trent C. Bjorndahl, Carol L. Ladner-Keay, Rolando Pérez, Burim N. Ametaj, David S. Wishart

Notice bibliographique

RevuePrion · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensNational Institute for NanotechnologyUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Prion Research InstituteDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésRecombinant DNAGene isoformLipopolysaccharideGuanidineChemistryProteinase KBiochemistryCofactorEndogenyBacterial outer membranePeptideCell biologyBiophysicsEnzymeEscherichia coliBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The conformational conversion of the cellular prion protein (PrP(C)) to the β-rich infectious isoform PrP(Sc) is considered a critical and central feature in prion pathology. Although PrP(Sc) is the critical component of the infectious agent, as proposed in the "protein-only" prion hypothesis, cellular components have been identified as important cofactors in triggering and enhancing the conversion of PrP(C) to proteinase K resistant PrP(Sc). A number of in vitro systems using various chemical and/or physical agents such as guanidine hydrochloride, urea, SDS, high temperature, and low pH, have been developed that cause PrP(C) conversion, their amplification, and amyloid fibril formation often under non-physiological conditions. In our ongoing efforts to look for endogenous and exogenous chemical mediators that might initiate, influence, or result in the natural conversion of PrP(C) to PrP(Sc), we discovered that lipopolysaccharide (LPS), a component of gram-negative bacterial membranes interacts with recombinant prion proteins and induces conversion to an isoform richer in β sheet at near physiological conditions as long as the LPS concentration remains above the critical micelle concentration (CMC). More significant was the LPS mediated conversion that was observed even at sub-molar ratios of LPS to recombinant ShPrP (90-232).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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