MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2002006497 · doi:10.1016/s0378-1097(03)00956-x

Production of heterologous protein by<i>Methylobacterium extorquens</i>in high cell density fermentation

2004· article· en· W2002006497 sur OpenAlexafffund
L Bélanger, M. M. Figueira, Denis Bourque, Lyne Morel, M Béland, Louise Laramée, Denis Groleau, C.B Mı́guez

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensNational Research Council CanadaBiotechnology Research InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésHeterologousMethylobacteriumFermentationChemistryYeastBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The green fluorescent protein (GFP) was used as a model protein to study the recombinant protein production by the strain Methylobacterium extorquens ATCC 55366. Scale-up from shake flasks to 20 l fed-batch fermentation was achieved using methanol as a sole carbon and energy source and a completely minimal culture medium. Two different expression vectors were used to express GFP. Clone PCM-GFP containing the vector pCM110 with native promoter of the methanol dehydrogenase PmxaF produced approximately 100-fold more GFP than the clone PRK-GFP containing the vector pRK310 with the heterogeneous promoter Plac. Several fed-batch fermentations with and without selective pressure (tetracycline) were run in a 20 l stirred tank fermenter using the two different clones of M. extorquens. The methanol concentration was monitored with an on-line semiconductor gas sensor in the culture broth. It was maintained at a non-toxic level of 1.4 g l(-1) with an adaptative control which regulates the methanol feed rate. The same growth profile was achieved in all fermentations. The maximum growth rate (micro(max)) was 0.18 h(-1) with an overall yield (Y(X/S)) of 0.3 g g(-1) methanol. With this high cell density fermentation process, we obtained high levels (up to 4 g l(-1)) of GFP with the clone PCM-GFP. The maximum specific GFP production (Y(GFP/X)) with this clone was 80 mg g(-1) representing approximately 16% of the total cell protein. Additional feeding of pure oxygen to the fermenter permitted a longer phase of exponential growth but had no effect on the total yields of biomass and GFP. The specific GFP production of clone PCM-GFP remained unaffected in the presence or absence of selective pressure (tetracycline), within the initial 50 h of the fermentation culture. These results suggest that M. extorquens ATCC 55366 could be an interesting candidate for overexpression of recombinant proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,180
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEMS Microbiology LettersMême sujetMicrobial Metabolic Engineering and BioproductionTravaux en français237 207