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Enregistrement W2002521218 · doi:10.1094/pdis.2002.86.10.1178c

<i>Botrytis porri</i> in Onion Seed Crops and Onion Seed

2002· article· en· W2002521218 sur OpenAlexaffabout
Lindsey J. du Toit, M. L. Derie, Tom Hsiang, Gary Q. Pelter

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPotato dextrose agarAlliumBotrytisHorticultureAgarSporeSclerotiumLiliumBotanyBulbLiliaceaeOrnamental plantAgar plateVeterinary medicineBotrytis cinereaBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nine fields direct-seeded with onion (Allium cepa L.) were surveyed in central Washington in the spring and summer of 2001 for Botrytis species associated with onion seed crops produced in this semiarid region. Forty plants were sampled from each field in a 'W' pattern in April, and 20 plants were similarly sampled from each field in June and July. Each plant was placed in a separate plastic bag, stored at 4 ± 2°C for 3 to 5 weeks, sliced lengthwise using a knife sterilized with 70% ethyl alcohol, incubated in a moist chamber for 5 days, and examined under a dissecting microscope. Fungal growth resembling Botrytis spp. was transferred to acidified potato dextrose agar (PDA) for species identification based on colony morphology, rate of growth, and spore and sclerotium characteristics (3). Cultures were incubated on a laboratory bench at 24 ± 4°C with 8 to 16 h of daylight. A species resembling B. porri (3) was detected in 3 fields in April at an incidence ranging from 3 to 28%, and in 2 of the same 3 fields in each of June and July at incidences ranging from 5 to 10%. Infected plants were asymptomatic at the time of sampling. The isolates formed brown, cerebriform sclerotia and sporulated sparsely. Subsamples of seed harvested from each field were assayed for Botrytis spp. To detect internal infection, 400 seeds from each of the nine fields were soaked in 0.525% NaOCl for 60 s, triple-rinsed in sterile deionized water, air dried, placed on a selective agar medium (2) with 20 seed per 9-cm-diameter petri plate, and incubated at 24°C (12 h day/night) for 14 days. Seeds were examined 5, 10, and 14 days after plating, and fungi resembling Botrytis spp. were transferred to acidified PDA for species determination. Isolates resembling B. porri were detected in 0.75% of seed from two of the three fields in which this species was isolated from plant samples. The internal transcribed spacer 1 region of ribosomal DNA of four isolates of the putative B. porri (two from plant samples and two from seed) were sequenced, and all four sequences matched that of B. porri registered in GenBank (Accession No. Z99666) most closely. Botrytis porri is a pathogen of garlic (A. sativum L.), leek (A. porrum L.), and wild garlic (A. vineale L.), but can infect onion and shallot (A. ascalonicum L.) when inoculated on these hosts (1). To our knowledge, this is the first report of natural infection of onion by B. porri, and the first report of seedborne B. porri on onion. References: (1) W. R. Jarvis. Pathology. Page 62 in: Botryotinia and Botrytis Species: Taxonomy, Physiology, and Pathogenicity. Canada Department of Agriculture, Monograph No. 15, 1977. (2) G. Kritzman and D. Netzer. Phytoparasitica 6:3, 1978. (3) A. H. Presly. Plant Pathol. 34:422, 1985.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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