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Enregistrement W2002707868 · doi:10.1139/b07-083

Phylogenetic analyses of <i>Nematoctonus</i> and <i>Hohenbuehelia</i> (Pleurotaceae)

2007· article· en· W2002707868 sur OpenAlexafffundvenue
Alexandra T.E. Koziak, Kei Chin Cheng, R. Greg Thorn

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesDivision of Environmental BiologyNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Science Foundation
Mots-clésBiologyBotanyHyphaConidiumMonophylyPhylogenetic treeZoologyClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hohenbuehelia (Agaricales, Pleurotaceae) and Nematoctonus (Hyphomycetes) are the names for the sexual and asexual stages of a genus of nematode-destroying fungi (Basidiomycota). We obtained partial sequences of nuclear ribosomal DNA, including the internal transcribed spacer region and the 5′ end of the large subunit, of 37 isolates of Hohenbuehelia and Nematoctonus representing 13 of the 16 described species in Nematoctonus. Phylogenetic analyses support Hohenbuehelia–Nematoctonus as a monophyletic clade of the Pleurotaceae, within which the species were placed in five main subclades. Exclusively predatory species ( Nematoctonus brevisporus Thorn &amp; G.L. Barron, Nematoctonus campylosporus Drechsler, Nematoctonus robustus F.R. Jones, and Nematoctonus sp. UAMH 5317) appear to be basal. In these species, adhesive knobs to capture prey are produced on their hyphae but not on their conidia. A single mycelial individual may feed on many nematodes. From these have arisen both exclusively parasitoid species ( Nematoctonus cylindrosporus Thorn &amp; G.L. Barron, Nematoctonus leiosporus Drechsler, Nematoctonus leptosporus Drechsler, Nematoctonus pachysporus Drechsler, Nematoctonus tylosporus Drechsler), and species that we call intermediate predators ( Nematoctonus angustatus Thorn &amp; G.L. Barron, Nematoctonus concurrens Drechsler, Nematoctonus geogenius Thorn &amp; GL. Barron, Nematoctonus hamatus Thorn &amp; G.L. Barron, and Nematoctonus subreniformis Thorn &amp; G.L. Barron). Exclusively parasitoid species have conidia that germinate to form sticky knobs that attach to passing nematodes but lack adhesive knobs on the hyphae. Each mycelial individual feeds on only one nematode. Intermediate predators have adhesive knobs both on hyphae and on germinated conidia and can act in both predatory and parasitoid modes. Most morphospecies are resolved as monophyletic, but sequences of additional gene regions are required to clarify species limits within the N. angustatus – N. geogenius group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,854
Score d'incertitude au seuil0,568

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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