Phylogeography of the Barred Owl (<i>Strix varia</i>): Species limits, multiple refugia, and range expansion
Notice bibliographique
Résumé
The Barred Owl (Strix varia) is a common nonmigratory owl distributed across southern Canada, south to California in the west, and to Texas and Florida in the east, with isolated populations in central Mexico. We examined the genetic structure of Barred Owl populations throughout their range using 500–600 base pairs each of one nuclear and three mitochondrial genes. In 75% of the shortest trees and 64% of the bootstrapped trees, Barred Owls were not monophyletic; rather, S. v. sartorii of Mexico was separated from the remaining taxa of S. varia by S. fulvescens of Central America. Consequently, the Barred Owls of Mexico are a species-level taxon. There was a large component (32%) of genetic variance distributed among population samples from the United States and Canada because of the occurrence of two clades of haplotypes (4.8% sequence divergence) with differing geographic distributions. One clade was predominant along the Atlantic Coast and the second in the south-central United States. The two clades co-occurred from the central Gulf Coast to the Upper Midwest, and across Canada to the Pacific. Nucleotide diversity was greatest where the clades overlapped in occurrence; mismatch distributions possessed the signatures of population expansion from the southern and eastern states to northern and western locations. These results suggest two Pleistocene refugia for northern populations of Barred Owls. Diversity within populations and divergence between haplotype clades varied by an order of magnitude among the three mitochondrial genes, but each recovered the overall phylogeographic pattern. The nuclear sequences showed much less variation and differentiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».