MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2002765389 · doi:10.1525/auk.2011.11057

Phylogeography of the Barred Owl (<i>Strix varia</i>): Species limits, multiple refugia, and range expansion

2011· article· en· W2002765389 sur OpenAlexaboutno aff
George F. Barrowclough, Jeff G. Groth, Karan J. Odom, Jonas E. Lai

Notice bibliographique

RevueThe Auk · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAmerican Ornithologists' Union
Mots-clésPhylogeographyRange (aeronautics)CladeMonophylyPopulationTaxonGeographyBiologyEcologyNucleotide diversityZoologyHaplotypePhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Barred Owl (Strix varia) is a common nonmigratory owl distributed across southern Canada, south to California in the west, and to Texas and Florida in the east, with isolated populations in central Mexico. We examined the genetic structure of Barred Owl populations throughout their range using 500–600 base pairs each of one nuclear and three mitochondrial genes. In 75% of the shortest trees and 64% of the bootstrapped trees, Barred Owls were not monophyletic; rather, S. v. sartorii of Mexico was separated from the remaining taxa of S. varia by S. fulvescens of Central America. Consequently, the Barred Owls of Mexico are a species-level taxon. There was a large component (32%) of genetic variance distributed among population samples from the United States and Canada because of the occurrence of two clades of haplotypes (4.8% sequence divergence) with differing geographic distributions. One clade was predominant along the Atlantic Coast and the second in the south-central United States. The two clades co-occurred from the central Gulf Coast to the Upper Midwest, and across Canada to the Pacific. Nucleotide diversity was greatest where the clades overlapped in occurrence; mismatch distributions possessed the signatures of population expansion from the southern and eastern states to northern and western locations. These results suggest two Pleistocene refugia for northern populations of Barred Owls. Diversity within populations and divergence between haplotype clades varied by an order of magnitude among the three mitochondrial genes, but each recovered the overall phylogeographic pattern. The nuclear sequences showed much less variation and differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,460
Score d'incertitude au seuil0,189

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe AukMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207