The N-terminal Amphipathic α-Helix of Viperin Mediates Localization to the Cytosolic Face of the Endoplasmic Reticulum and Inhibits Protein Secretion
Notice bibliographique
Résumé
Viperin is an evolutionarily conserved interferon-inducible protein that localizes to the endoplasmic reticulum (ER) and inhibits a number of DNA and RNA viruses. In this study, we report that viperin specifically localizes to the cytoplasmic face of the ER and that an amphipathic alpha-helix at its N terminus is necessary for the ER localization of viperin and sufficient to promote ER localization of a reporter protein, dsRed. Overexpression of intact viperin but not the amphipathic alpha-helix fused to dsRed induced crystalloid ER. Consistent with other proteins that induce crystalloid ER, viperin self-associates, and it does so independently of the amphipathic alpha-helix. Viperin expression also affected the transport of soluble but not membrane-associated proteins. Expression of intact viperin or an N-terminal alpha-helix-dsRed fusion protein significantly reduced secretion of soluble alkaline phosphatase and reduced its rate of ER-to-Golgi trafficking. Similarly, viperin expression inhibited bulk protein secretion and secretion of endogenous alpha(1)-antitrypsin and serum albumin from HepG2 cells. Converting hydrophobic residues in the N-terminal alpha-helix to acidic residues partially or completely restored normal transport of soluble alkaline phosphatase, suggesting that the extended amphipathic nature of the N-terminal alpha-helical domain is essential for inhibiting protein secretion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».