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Enregistrement W2002991724 · doi:10.1210/me.2010-0005

Conformation of the Mineralocorticoid Receptor N-terminal Domain: Evidence for Induced and Stable Structure

2010· article· en· W2002991724 sur OpenAlexfundno aff
Katharina Fischer, Sharon M. Kelly, Kate Watt, Nicholas C. Price, Iain J. McEwan

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsDirectorate for Biological SciencesUniversity of AberdeenImperial College London
Mots-clésTransactivationBiologyMineralocorticoid receptorCoactivatorNuclear receptorProtein foldingProtein structureContext (archaeology)Cell biologyPlasma protein bindingBinding siteReceptorBiophysicsBiochemistryGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mineralocorticoid receptor (MR) binds the steroid hormones aldosterone and cortisol and has an important physiological role in the control of salt homeostasis. Regions of the protein important for gene regulation have been mapped to the amino-terminal domain (NTD) and termed activation function (AF)1a, AF1b, and middle domain (MD). In the present study, we used a combination of biophysical and biochemical techniques to investigate the folding and function of the MR-NTD transactivation functions. We demonstrate that MR-AF1a and MR-MD have relatively little stable secondary structure but have the propensity to form α-helical conformation. Induced folding of the MR-MD enhanced protein-protein binding with a number of coregulatory proteins, including the coactivator cAMP response element-binding protein-binding protein and the corepressors SMRT and RIP140. By contrast, the MR-AF1b domain appeared to have a more stable conformation consisting predominantly of β-secondary structure. Furthermore, MR-AF1b specifically interacted with the TATA-binding protein, via an LxxLL-like motif, in the absence of induced folding. Together, these data suggest that the MR-NTD contains a complex transactivation system made up of distinct structural and functional domains. The results are discussed in the context of the induced folding paradigm for steroid receptor NTDs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,196

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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