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Enregistrement W2003058643 · doi:10.1158/1541-7786.mcr-07-0068

Oncogenic Activation of the Human <i>Pygopus2</i> Promoter by E74-Like Factor-1

2008· article· en· W2003058643 sur OpenAlexaff
Phillip Andrews, Mark Kennedy, Cathy Popadiuk, Kenneth R. Kao

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscription factorChromatin immunoprecipitationBiologyWnt signaling pathwayPromoterGene silencingMolecular biologyTranscription (linguistics)ChromatinHeLaCancer researchRNA interferenceCell biologyTranscriptional regulationGeneCell cultureGene expressionSignal transductionRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pygopus is a component of the T-cell factor/beta-catenin transcriptional complex essential for activation of Wnt target genes and is also required for cell regulation in the absence of Wnt signaling. Human Pygopus2 (hPygo2) is overexpressed in a high proportion of breast and epithelial ovarian malignant tumors and is required for the growth of several cell lines derived from these carcinomas. The mechanisms regulating hPygo2 gene activation, however, are unknown. Here, we have determined cis- and trans-interacting factors responsible for hPygo2 expression in cancer. The minimal region required for a maximal 109-fold activation of the hPygo2 promoter in MCF-7 breast cancer cells is 48 bp upstream of the start of transcription. Within 25 bp of the transcriptional start, there are two overlapping tandem Ets transcription factor-binding sites, which are critical for hPygo2 promoter activity. In vitro DNA pull-down assays and proteomic analyses identified the Ets family members Elk-1 and E74-like factor-1 (Elf-1) as potential hPygo2 promoter binding factors, whereas in vivo chromatin immunoprecipitation assays verified that only Elf-1 specifically bound to the hPygo2 promoter in MCF-7 cells. Modulation of elf-1 in MCF-7 cells by silencing via RNA interference or overexpression caused a corresponding decrease or increase, respectively, in hPygo2 promoter activity. Overexpression of Elf-1 in HeLa cells, in which Elf-1 is expressed at a lower level than in MCF-7 cells, caused a 4-fold increase in endogenous hPygo2 mRNA levels. These results provide new evidence that Elf-1 is involved in transcriptional activation of hPygo2. Like hPygo2, previous studies implicated Elf-1 in breast and ovarian cancer and our present findings suggest that the oncogenic requirement of hPygo2 is fulfilled, in part, by Elf-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,485

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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