Returning to the stem state: Epigenetics of recapitulating pre‐differentiation chromatin structure
Notice bibliographique
Résumé
Embryonic stem cells (ESCs) and induced pluripotent stem cells (iPSCs) can self-renew indefinitely and contribute to all tissue types of the adult organism. Stem cell-based therapeutic approaches hold enormous promise for the cure of regenerative diseases. Over the last few years, several studies have attempted to decipher the important role of transcription factor networks and epigenetic regulatory signals in the maintenance of ESC pluripotency, but the exact underlying mechanisms have yet to be identified. Among the epigenetic factors, chromatin dynamics and structure have been found to contribute greatly to maintenance of pluripotency and regulation of differentiation in ESCs. These modifications include: covalent histone acetylation and methylation, histone bivalents and chromatin remodeling, and DNA methylation. Studies in ESCs have shown that genes associated with early development are arranged within a bivalent chromatin structure. This is thought to be a "poised yet repressed" situation, which can be activated upon differentiation. The breakthrough of iPSCs has opened a new era in stem cell biology. During reprogramming, the chromatin state of differentiated cells is reset to an embryonic form via a largely unknown mechanism. In this review, the fundamental impact of chromatin dynamic in ESCs as well as its critical role in the generation of iPSCs is discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».