MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2003250911 · doi:10.1359/jbmr.091109

Relationship between genotype and skeletal phenotype in children and adolescents with osteogenesis imperfecta

2009· article· en· W2003250911 sur OpenAlexaff
Frank Rauch, Liljana Lalic, Peter J. Roughley, Francis H. Glorieux

Notice bibliographique

RevueJournal of Bone and Mineral Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnective tissue disorders research
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesShriners Hospitals for Children
Mots-clésOsteogenesis imperfectaHaploinsufficiencyBone mineralMedicineBone densityInternal medicineGenotypeEndocrinologyGastroenterologyOsteoporosisPhenotypeGeneticsPathologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteogenesis imperfecta (OI) is a heritable bone fragility disorder that in the majority of cases is caused by mutations in COL1A1 or COL1A2, the genes that encode the two collagen type I alpha chains, alpha1(I) and alpha2(I). In this study, we examined the relationship between collagen type I mutations and bone densitometric and histomorphometric findings in pediatric OI patients who had not received bisphosphonate treatment. Lumbar spine areal bone mineral density (LS aBMD) was measured in 192 patients (99 girls, 93 boys; age range 3 weeks to 16.9 years) who had either COL1A1 mutations leading to haploinsufficiency (n = 52) or mutations that lead to the substitution of glycine by another amino acid in the triple-helical domain of either the alpha1(I) (n = 58) or the alpha2(I) chain (n = 82). Compared with patients with helical mutations, patients with COL1A1 haploinsufficiency on average were taller and heavier and had higher LS aBMD. After adjustment for age, sex, and height Z-scores, the mean LS aBMD Z-scores were -4.0 for the haploinsufficiency group and -4.7 for both helical mutation groups. In the whole patient population, the average LS aBMD Z-score was higher by 0.6 (95% confidence interval 0.2-1.0) in girls than in boys. Iliac bone histomorphometry (in a subgroup of 96 patients) showed that outer bone size (core width) and trabecular bone volume were similar between genotypic groups, but cortical width was 49% higher in the haploinsufficiency group compared with patients with helical mutations in alpha2(I). Bone turnover parameters were lower in the haploinsufficiency group than in patients with helical mutations. In the group of patients with helical mutations, neither the type of alpha chain affected, nor the type of amino acid substituting for glycine, nor the position of the mutation in the alpha chain had a detectable relationship with LS aBMD or histomorphometric results. Thus patients with haploinsufficiency mutations had a milder skeletal phenotype than patients with mutations affecting glycine residues, but there was no clear genotype-phenotype correlation among patients with helical glycine mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Bone and Mineral ResearchMême sujetConnective tissue disorders researchTravaux en français237 207