Frequent mutation of histone-modifying genes in non-Hodgkin lymphoma

2011· article· en· 1 603 citations· W2003262666 sur OpenAlex· 10.1038/nature10351

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

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Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,009

Tête enseignante GPT0,286

Écart entre enseignants: 0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Follicular lymphoma (FL) and diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) are the two most common non-Hodgkin lymphomas (NHLs). Here we sequenced tumour and matched normal DNA from 13 DLBCL cases and one FL case to identify genes with mutations in B-cell NHL. We analysed RNA-seq data from these and another 113 NHLs to identify genes with candidate mutations, and then re-sequenced tumour and matched normal DNA from these cases to confirm 109 genes with multiple somatic mutations. Genes with roles in histone modification were frequent targets of somatic mutation. For example, 32% of DLBCL and 89% of FL cases had somatic mutations in MLL2, which encodes a histone methyltransferase, and 11.4% and 13.4% of DLBCL and FL cases, respectively, had mutations in MEF2B, a calcium-regulated gene that cooperates with CREBBP and EP300 in acetylating histones. Our analysis suggests a previously unappreciated disruption of chromatin biology in lymphomagenesis. Despite being a focus of research activity for many years, the mutations driving the two most common non-Hodgkin lymphomas — follicular lymphoma and diffuse large B-cell lymphoma — have remained cryptic. Whole genome sequencing, combined with transcriptome analysis and further resequencing of candidate genes in additional tumours, now show that histone methyltransferases and acetylases are frequently affected by mutations in these tumours. This study suggests a previously unappreciated importance of chromatin biology in lymphomagenesis.

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La notice

Revue: Nature
Thématique: Cancer-related gene regulation
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: University of British ColumbiaSimon Fraser UniversityCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnaires: Provincial Health Services AuthorityTerry Fox FoundationGenome British ColumbiaMichael Smith Health Research BCCanadian Institutes of Health ResearchCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreGenome CanadaLeukemia and Lymphoma SocietyNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clés: BiologyGeneSomatic cellHistoneCancer researchMutationGeneticsLymphomaDiffuse large B-cell lymphomaGermline mutationChromatinFollicular lymphomaCarcinogenesisImmunology
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W2003262666