Specific synthetic lethal killing of RAD54B-deficient human colorectal cancer cells by FEN1 silencing
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Mutations that cause chromosome instability (CIN) in cancer cells produce "sublethal" deficiencies in an essential process (chromosome segregation) and, therefore, may represent a major untapped resource that could be exploited for therapeutic benefit in the treatment of cancer. If second-site unlinked genes can be identified, that when knocked down, cause a synthetic lethal (SL) phenotype in combination with a somatic mutation in a CIN gene, novel candidate therapeutic targets will be identified. To test this idea, we took a cross species SL candidate gene approach by recapitulating a SL interaction observed between rad54 and rad27 mutations in yeast, via knockdown of the highly sequence- and functionally-related proteins RAD54B and FEN1 in a cancer cell line. We show that knockdown of RAD54B, a gene known to be somatically mutated in cancer, causes CIN in mammalian cells. Using high-content microscopy techniques, we demonstrate that RAD54B-deficient human colorectal cancer cells are sensitive to SL killing by reduced FEN1 expression, while isogenic RAD54B proficient cells are not. This conserved SL interaction suggests that extrapolating SL interactions observed in model organisms for homologous genes mutated in human cancers will aid in the identification of novel therapeutic targets for specific killing of cancerous cells exhibiting CIN.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle