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Enregistrement W2003583829 · doi:10.1167/iovs.11-8418

Differential Gene Expression in Eyecup and Retina of a Mouse Model of Stargardt-like Macular Dystrophy (STGD3)

2011· article· en· W2003583829 sur OpenAlexafffund
Sharee Kuny, Frédéric Gaillard, Yves Sauvé

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRetinaGlial fibrillary acidic proteinDownregulation and upregulationBiologyRetinal degenerationDystrophyMacular dystrophyPhotoreceptor cellGenetically modified mouseRetinalMolecular biologyCell biologyTransgeneImmunologyImmunohistochemistryGeneGeneticsNeuroscienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To investigate differentially expressed genes in eyecup and retina of the ELOVL4 transgenic mouse, a model of Stargardt-like macular dystrophy (STGD3). METHODS: We examined gene and protein expression in known pathways relevant to retinal degeneration using PCR arrays, Western blotting, and immunohistochemistry. Investigations were performed on ELOVL4 transgenic mice at 9 months, when 50% of rod (but no cone) photoreceptors had degenerated. Age-matched wild-type littermates served as controls. RESULTS: Significant expression level changes were found in only 17 of the 252 genes examined. Nine were upregulated (Fgf2, Fgfr1, Ntf5, Cbln1, Ngfr, Ntrk1, Trp53, Tlr6, and Herpud1), and eight were downregulated (Ccl22, Ccr3, Il18rap, Nf1, Ccl11, Atf6β, Rpn1, and Serp1). Overexpression of FGF2 was detected at 1 month, before rod loss onset, and was maintained at high levels until cone loss (18 months). By 9 months, FGF2 overexpression was seen in photoreceptor cell bodies. Increased glial fibrillary acidic protein (GFAP) expression due to glial cell reactivity followed the same time course. Levels of NGFR/p75NTR remained invariant. Although present in rod outer segments at 1 month, the macrophage chemoattracting chemokine CCL22 became undetectable by 9 months, a likely consequence of progressive rod outer segment truncation. CONCLUSIONS: At a mid-degeneration stage, major changes in gene expression in the ELOVL4 transgenic mouse retina included upregulation of Fgf2 and Fgfr1 and downregulation of Ccl22. Modulation of FGF2 occurred very early, concomitant with an increase in GFAP expression. Future studies will address which factors upstream of Fgf2 could provide potential therapeutic targets to slow photoreceptor degeneration in STGD3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,967

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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