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Enregistrement W2004153631 · doi:10.1021/bi060283t

Catalysis of Covalent Lp(a) Assembly:  Evidence for an Extracellular Enzyme Activity that Enhances Disulfide Bond Formation

2006· article· en· W2004153631 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCovalent bondDisulfide bondChemistryExtracellularEnzymeBiochemistryBiophysicsStereochemistryBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The assembly of lipoprotein(a) (Lp(a)) particles occurs via a two-step mechanism in which noncovalent interactions between apolipoprotein(a) (apo(a)) and the apolipoproteinB-100 component of low density lipoprotein precede the formation of a single disulfide bond. Although we have previously demonstrated that the rate constant for the covalent step of Lp(a) assembly can be enhanced by altering the conformational status of apo(a), the resultant rates of covalent Lp(a) particle formation measured in vitro are relatively slow. The large excess of Lp(a) (over apo(a)) observed in vivo can be accounted for by a preferential clearance of apo(a) over Lp(a) and/or a sufficiently high rate of covalent Lp(a) assembly. In the present study, we report that cultured human hepatoma cells secrete an oxidase activity that dramatically enhances the rate of covalent Lp(a) assembly. This activity is likely possessed by a protein because it is heat-sensitive and is retained in the concentrate following ultrafiltration through a 5 kDa cutoff filter. However, a small molecule cofactor for the activity is suggested by the observation that the activity is lost upon dialysis. Plots of Lp(a) assembly rate versus input apo(a) concentration gave rectangular hyperbolae; the reaction displayed an unusual dependence on the concentration of apoB-100, with increasing concentrations of apoB-100 resulting in slower rates of Lp(a) assembly at low concentrations of apo(a), an effect that was alleviated by higher apo(a) concentrations. Interestingly, V(max(app))/K(m(app)) ratios were insensitive to apoB-100 concentration, which is diagnostic of a ping-pong reaction mechanism. In this way, the putative Lp(a) oxidase may be functionally analogous to protein disulfide isomerase, which exhibits a similar mechanism during the catalysis of disulfide bond formation during protein folding, although we have ruled out a role for this enzyme in Lp(a) assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,669

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle