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Enregistrement W2004182889 · doi:10.1136/archdischild-2014-307384.521

PS-222 Staphylococcus Capitis In Neonatal Late-onset Sepsis: Unexpected Worldwide Dissemination Of An Endemic Multi-resistant Clone

2014· article· en· W2004182889 sur OpenAlexaboutno aff
Marine Butin, Patrícia Martins-Simões, Hajar Lemriss, Sanaâ Lemriss, François Vandenesch, Olivier Claris, JC Picaud, JP Rasigade, Frédéric Laurent

Notice bibliographique

RevueArchives of Disease in Childhood · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSepsisclone (Java method)Staphylococcus aureusPediatricsStaphylococcal infectionsNeonatal sepsisImmunologyBacteriaGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Multi-resistant Staphylococcus capitis NRCS-A is involved in late-onset sepsis (LOS) in French NICUs. Aims To investigate the geographical distribution of NRCS-A, and to precise its susceptibility profile. Methods Twelve S. capitis isolates from distant NICUs (Australia, Belgium, France, United Kingdom, n = 3 each) and 2 S. capitis isolates from adult patients were analysed using PFGE, SCCmec typing, dru-typing, a MLST-like analysis, and antimicrobial susceptibility testing. To explore impact of vancomycin selective pressure, after 15 daily subcultures with vancomycin, we determined vancomycin, daptomycin and linezolid minimal inhibitory concentrations (MICs). Results All NICU S. capitis (i) shared >80% similarity of PFGE profile and were similar to NRCS-A profile, (ii) harboured a type V-related SCCmec element, (iii) exhibited the same dru-type, (iv) formed a monophyletic group, (v) harboured a same antimicrobial susceptibility profile including aminoglycosides and methicillin resistance, and vancomycin heteroresistance. These molecular and antimicrobial susceptibility profiles differed from those of adult isolates. An increase of vancomycin and daptomycin (but not linezolid) MICs was observed, significantly faster (p < 0.05) for NRCS-A isolates than other tested strains. Conclusion Our analysis demonstrates an unexpected worldwide distribution of S. capitis NRCS-A, specifically in NICUs. Recently, we collected complementary NICU isolates belonging to NRCS-A from Norway, Denmark, the Netherlands, USA, Brazil, New Zealand and Canada, confirming the worrisome dissemination of NRCS-A. Its multi-resistant profile and its ability to rapidly adapt to vancomycin selective pressure, constitute a selective advantage to NRCS-A in NICUs, and raise the issue of potential therapeutic failure and the need for alternative antimicrobial regimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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