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Enregistrement W2004728197 · doi:10.1007/s10350-006-0568-4

Tumor Buds Show Reduced Expression of Laminin-5 Gamma 2 Chain in DNA Mismatch Repair Deficient Colorectal Cancer

2006· article· en· W2004728197 sur OpenAlexaff
Eiji Shinto, Kristi Baker, Hitoshi Tsuda, Hidetaka Mochizuki, Hideki Ueno, Osamu Matsubara, William D. Foulkes, Jeremy R. Jass

Notice bibliographique

RevueDiseases of the Colon & Rectum · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMLH1Colorectal cancerMedicineTumor buddingMouse model of colorectal and intestinal cancerCancer researchDNA methylationCancerOncologyInternal medicinePathologyDNA mismatch repairBiologyGene expressionMetastasisGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Tumor budding at the invasive margin of colorectal cancer is an important adverse prognostic factor. The subset of colorectal cancer that is deficient in DNA mismatch repair has been associated with a good prognosis. It is hypothesized that tumor budding in this subset may lack biologic aggressiveness because it is not associated with aberrant expression of the independent prognostic factor, laminin-5 gamma 2. METHODS: Eighty colorectal cancers with high-grade tumor budding were studied, including nine sporadic colorectal cancers with immunohistochemical loss of expression of MLH1 (MLH1(-)), seven colorectal cancers from patients with hereditary nonpolyposis colorectal cancer, and 64 sporadic colorectal cancers expressing both MLH1 and MSH2 (MLH1(+)). Two regulatory mechanisms for laminin-5 gamma 2 expression were explored, including aberrant nuclear expression of beta-catenin by immunohistochemistry and promoter methylation of laminin-5 gamma 2 by methylation-specific polymerase chain reaction. RESULTS: Only three of nine MLH1(-) colorectal cancers showed expression of laminin-5 gamma 2 compared with 46 of 64 MLH1(+) colorectal cancers (P = 0.05). Only two of seven hereditary nonpolyposis colorectal cancers expressed laminin-5 gamma 2 compared with MLH1(+) colorectal cancers (P= 0.03). Expression of nuclear beta-catenin was more frequent (58 percent) in MLH1(+) colorectal cancers compared with MLH1(-) colorectal cancers (11 percent, P = 0.01). Methylation of laminin-5 gamma 2 was found in 5 of 38 (13 percent) cases but did not differ among colorectal cancer subsets. Four of five colorectal cancers with methylation of laminin-5 gamma 2 were scored as negative for laminin-5 gamma 2 by immunohistochemistry. CONCLUSIONS: The reduced expression of laminin-5 gamma 2 in colorectal cancers with deficient DNA mismatch repair may underlie a variant of tumor budding that is relatively nonaggressive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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