Tumor Buds Show Reduced Expression of Laminin-5 Gamma 2 Chain in DNA Mismatch Repair Deficient Colorectal Cancer
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Tumor budding at the invasive margin of colorectal cancer is an important adverse prognostic factor. The subset of colorectal cancer that is deficient in DNA mismatch repair has been associated with a good prognosis. It is hypothesized that tumor budding in this subset may lack biologic aggressiveness because it is not associated with aberrant expression of the independent prognostic factor, laminin-5 gamma 2. METHODS: Eighty colorectal cancers with high-grade tumor budding were studied, including nine sporadic colorectal cancers with immunohistochemical loss of expression of MLH1 (MLH1(-)), seven colorectal cancers from patients with hereditary nonpolyposis colorectal cancer, and 64 sporadic colorectal cancers expressing both MLH1 and MSH2 (MLH1(+)). Two regulatory mechanisms for laminin-5 gamma 2 expression were explored, including aberrant nuclear expression of beta-catenin by immunohistochemistry and promoter methylation of laminin-5 gamma 2 by methylation-specific polymerase chain reaction. RESULTS: Only three of nine MLH1(-) colorectal cancers showed expression of laminin-5 gamma 2 compared with 46 of 64 MLH1(+) colorectal cancers (P = 0.05). Only two of seven hereditary nonpolyposis colorectal cancers expressed laminin-5 gamma 2 compared with MLH1(+) colorectal cancers (P= 0.03). Expression of nuclear beta-catenin was more frequent (58 percent) in MLH1(+) colorectal cancers compared with MLH1(-) colorectal cancers (11 percent, P = 0.01). Methylation of laminin-5 gamma 2 was found in 5 of 38 (13 percent) cases but did not differ among colorectal cancer subsets. Four of five colorectal cancers with methylation of laminin-5 gamma 2 were scored as negative for laminin-5 gamma 2 by immunohistochemistry. CONCLUSIONS: The reduced expression of laminin-5 gamma 2 in colorectal cancers with deficient DNA mismatch repair may underlie a variant of tumor budding that is relatively nonaggressive.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».