The TatA Subunit of<i>Escherichia coli</i>Twin-Arginine Translocase Has an N-in Topology
Notice bibliographique
Résumé
The twin-arginine translocase (Tat) system is used by many bacteria to translocate folded proteins across the cytoplasmic membrane. The TatA subunit is the predicted pore-forming subunit and has been shown to form a homo-oligomeric complex. Through accessibility experiments using the thiol-reactive reagents 4-acetamido-4'-maleimidylstilbene-2,2'-disulfonic acid and Nalpha-(3-maleimidylproprionyl)biocytin toward site-specific cysteine mutants in TatA, we show that the N-terminus of TatA is located in the cytoplasm rather than the previously assumed periplasm. We also confirm previous observations that the C-terminus has a dual topology. By treatment with the membrane uncoupler carbonyl cyanide-m-chlorophenyl hydrazone, we show that the topological state of the C-terminus is dependent on the membrane potential. These results suggest two architectures of TatA in the membrane: one with a single transmembrane helix and the other with two transmembrane helices. Molecular models of both topologies were used to develop and cartoon a homo-oligomeric complex as a channel with a diameter of approximately 50 A and suggest that the double transmembrane helix topology might be the building block for the translocation channel. Additionally, in vivo cross-linking experiments of Gly2Cys and Thr22Cys mutants showed that Gly2, at the beginning of transmembrane helix-1, is in close proximity with Gly2 of a neighboring TatA, as Cys2 cross-linked immediately upon the addition of copper phenanthroline. On the other hand, Cys22, at the other end of the transmembrane helix, took at least 10 min to cross-link, suggesting that a possible movement or reorientation is required to bring this residue into proximity with a neighboring TatA subunit.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».