Linkage mapping of <i>Microphthalmia‐associated transcription factor</i> to cattle chromosome 22
Notice bibliographique
Résumé
Allele frequencies/Mendelian inheritance: Allele frequencies of SNP T-233C and SNP C641T were estimated in samples of unrelated (no full sibs) animals from six pig breeds (Table 2).Mendelian inheritances at the two SNP loci were confirmed in a three-generation population of White Duroc • Chinese Erhualian intercross.Association analysis: As the allele C of SNP C641T was fixed in the Duroc population, possible associations of the gene variant T-233C with backfat thickness were only calculated for the individuals of a purebred Duroc population using the General Linear Model procedure of the SAS package (version 8.2; SAS Inc., 2001, Cary, NC, USA).The model used genotype as fixed effect and sex as covariate.Twenty-two homozygotes of genotypes CC, 10 TT-homozygotes and thirtyseven heterozygotes were detected.No significant correlations of the T-233C polymorphism with backfat thickness were observed in the purebred Duroc population (P > 0.05, data not shown).Comments: The physiological role of the SCD gene in the lipid metabolism supports the hypothesis of SCD as a candidate gene for fatness traits in livestock.Nevertheless, the SNP T-233C located in the promoter was shown to have no major effects on backfat thickness in the Duroc population, indicating that the mutation may not alter the SCD expression.Additional polymorphisms of the porcine SCD gene have been recently characterized and deposited in the database (GenBank accession no.AY487830).Further association studies using appropriate populations may be worthwhile.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».