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Enregistrement W2006194421 · doi:10.1039/c3mt20240b

Effect of aluminium and copper on biofilm development of Pseudomonas pseudoalcaligenes KF707 and P. fluorescens as a function of different media compositions

2013· article· en· W2006194421 sur OpenAlexaff
Sean C. Booth, Iain George, Davide Zannoni, Martina Cappelletti, Gavin E. Duggan, Howard Ceri, Raymond J. Turner

Notice bibliographique

RevueMetallomics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas fluorescensBiofilmBacteriaChemistryEnvironmental chemistryBioremediationMetalFood scienceMicrobiologyBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bioremediation efforts worldwide are faced with the problem of metals interfering with the degradation of organic pollutants. There has been little systematic investigation into how the important environmental factors of media composition, buffering agent, and carbon source affect the exertion of metal toxicity on bacteria. This study aimed to systematically separate and investigate the influence of these factors by examining planktonic and biofilm establishment and growth. Two Pseudomonads were chosen, the PCB degrader P. pseudoalcaligenes KF707 and P. fluorescens. The two strains were grown in the presence of Al(3+) and Cu(2+) under different media conditions of carbon source (Lysogeny broth, biphenyl, succinate, aspartic acid, butyric acid, oxaloacetic acid, putrescine and benzoic acid) and under different buffering conditions (high and low phosphate or MOPS). These experiments allowed for the elucidation of an effect of different metabolic conditions and metal speciation on planktonic bacteria growth and biofilm establishment and development under metal stress. Here we show that the nature of bacterial growth (planktonic and biofilm development) is dramatically affected by the interplay between toxic metals, carbon source and media composition. The capacity of a media to bind toxic metals as well as quality of carbon source greatly influences the amount of metal that bacteria can tolerate, depending on both the bacterium and metal. Future studies evaluating metal ion toxicity should consider these effects, as well as their interactions with specific environments into account in order to improve clean-up success.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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