Genetic tools for highly pathogenic Francisella tularensis subsp. tularensis
Notice bibliographique
Résumé
This paper is the first detailed description of the development and use of new genetic tools specifically for the safe manipulation of highly pathogenic Francisella tularensis subsp. tularensis. Most of these tools are also demonstrated to work with other F. tularensis subspecies. Kanamycin and hygromycin resistance determinants that function as genetic markers in F. tularensis subsp. tularensis strain Schu and sets of episomal shuttle vectors that are either unstable or stably maintained in the absence of selection were developed. In addition, the hyg gene, expressed from the F. tularensis groESL promoter, was successfully used as a marker for transposon mutagenesis. This work also includes the development of sacB-based suicide plasmids expressing kanamycin resistance that can be used for electroporation-mediated allelic exchange of unmarked mutations in Schu and the F. tularensis live vaccine strain (LVS). Using these plasmids, the two predicted beta-lactamase genes, blaA and blaB, in Schu and LVS were deleted. Only the Delta blaB1 mutants had increased susceptibility to ampicillin, and this phenotype was complemented by a plasmid expressing blaB+. The results suggest that the beta-lactam antibiotic resistance phenotype of Schu and LVS is likely due to only one of the two beta-lactamase genes present and that ampicillin resistance can be used as an additional selectable marker in beta-lactamase deletion mutants. The collection of tools presented in this report will be helpful for the genetic analyses of F. tularensis subsp. tularensis pathogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».