Diminished Representation of HIV-1 Variants Containing Select Drug Resistance-Conferring Mutations in Primary HIV-1 Infection
Notice bibliographique
Résumé
This study compared the incidence of HIV-1 variants harboring mutations conferring resistance to thymidine analogues, ie, thymidine analogue mutations (TAMs), nonnucleoside reverse transcriptase (RT) inhibitors (NNMs), lamivudine (3TC) (ie, M184V), and protease inhibitors (PIs) acquired in primary HIV infection (PHI) (n = 59) to their observed prevalence in a corresponding potential transmitter (PT) population of persons harboring resistant infections (n = 380). Both of these populations in the context of this cohort analysis possessed similar demographics. Whereas the frequencies of observed TAMs, NNMs, M184V, and protease-associated mutations (PRAMs) were similar in the PT groups, the prevalence of M184V and major PI mutations were significantly lower in the PHI group (PHI/PT ratios of 0.14 and 0.39, respectively). There was a decreased prevalence in the PHI population of resistant viruses co-expressing NNMs or TAMs with M184V compared with viruses that harbored NNMs or TAMs in the absence of M184V (P < 0.0001). It was also observed that individuals in the PT subgroups who harbored RT mutations or PRAMs with M184V had lower levels of plasma viremia than individuals who lacked M184V (P < 0.05). These findings suggest that both decreased viremia and viral fitness in the case of M184V-containing HIV-1 variants may impact on viral transmissibility.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».