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Enregistrement W2007477253 · doi:10.1093/europace/euq161

Evaluation of non-synonymous NPPA single nucleotide polymorphisms in atrial fibrillation

2010· article· en· W2007477253 sur OpenAlexafffundabout
Joan Roberts, R. W. Davies, Steven A. Lubitz, Isabelle Thibodeau, Pablo B. Nery, David H. Birnie, Emelia J. Benjamin, Robert Lemery, Patrick T. Ellinor, Michael H. Gollob

Notice bibliographique

RevueEP Europace · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAtrial Fibrillation Management and Outcomes
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineOdds ratioSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineAtrial fibrillationCardiologyConfidence intervalPolymorphism (computer science)SNPGeneticsGenotypeGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Atrial fibrillation (AF), the most common sustained cardiac arrhythmia, is an important cause of morbidity and mortality. A genetic mutation in the NPPA gene, which encodes the atrial natriuretic peptide, has been identified as the putative causative factor in a family with an autosomal dominant pattern of inheritance for AF. Two common single nucleotide polymorphisms (SNPs) in NPPA, rs5063 and rs5065, result in amino acid changes of the primary peptide and have been previously implicated in conditions associated with AF, including stroke and hypertension. Recently, the rs5063 SNP has been reported to confer an increased risk of AF development in a Chinese population. We sought to examine the associations of both rs5063 and rs5065 with AF in two separate North American cohorts of European ancestry. METHODS AND RESULTS: Patients with early-onset AF, along with healthy controls, were recruited at the University of Ottawa Heart Institute (UOHI) and the Massachusetts General Hospital (MGH). Study participants were genotyped for rs5063 and rs5065 using a combination of restriction fragment length polymorphism analysis and DNA microarrays. The study genotyped a total of 620 AF cases and 2446 healthy controls. The UOHI arm of the study identified an odds ratio (OR) of 0.72 [95% confidence interval (CI): 0.42-1.24] for rs5063, whereas an OR of 1.33 (95% CI: 0.80-2.21) was observed in the MGH arm. The combined OR approximated unity (OR 0.99; 95% CI: 0.54-1.80). Analysis of rs5065 revealed an OR of 1.12 (95% CI: 0.84-1.48) in UOHI, 1.08 (95% CI 0.80-1.45) in MGH, and 1.10 (95% CI 0.90-1.35) when combined. CONCLUSION: Common non-synonymous genetic variants within NPPA in these two large North American cohorts of European ancestry are not associated with the development of AF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,523
Score d'incertitude au seuil0,449

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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