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Enregistrement W2007517497 · doi:10.1590/s0482-50042007000100012

Autoantibodies to novel cytoplasmic structures (GW bodies) involved in mRNA processing

2007· article· en· W2007517497 sur OpenAlexaffabout
Mittermayer B. Santiago, Theophany Eystathioy, Rahima A. Bhanji, Marvin J. Fritzler

Notice bibliographique

RevueRevista Brasileira de Reumatologia · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutoantibodyMessenger RNACytoplasmMedicineHeLaGeneCell cultureImmunologyPathologyCell biologyAntibodyBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This particular cytoplasmic discrete speckled pattern (1,2) is quite unique as the structures observed are a new entity named GW bodies (Figure 1), abbreviated GWBs (also known as mammalian P bodies or processing bodies). Functionally, GWBs are involved in the process of RNA interference (RNAi), mRNA degradation and/or mRNA storage. A subset of mRNAs are targeted to these cytoplasmic structures, therefore GWBs play a central role in the cell by influencing the fate of mRNAs. GWBs are ubiquitous and present in many tissues and cell lines as well as normal cells but appear to be more highly expressed in cancer cells such as HEp-2 (laryngeal carcinoma) and HeLa (cervical carcinoma) that are now routinely used to screen human sera for the presence of autoantibodies. To date, five target autoantigens in GWBs have been published. They include GW182, a unique protein characterized by a numerous glycine (G) and tryptophan (W) repeats(3), Ge-1/hedls (4,5), RAP-55(6), diacyl-phosphatidyl ethanolamine(2), and Su/hAgo2(7). The clinical diagnosis of patients with autoantibodies to GWBs can be divided into four main groups. In a study from the University of Calgary, the most common diagnosis is Sjogren’s syndrome, systemic lupus erythematosus (SLE), and the third group has neurological disease(3). In another study from Brazil(2) there was no clear cut clinical associations, although 3 patients with SLE were noted, but the majority comprise the fourth category of other conditions(2). The difference between the clinical profiles in these two centers may be explained on the basis of different clinical referral patterns. For example, in Calgary, serum samples of patients with suspected autoimmune neurological disease (ataxia, motor and sensory neuropathy) are routinely evaluated. Examination of 5000 patient serum samples received during 2000-2001, by ANA at the Mitogen Advanced Diagnostics Laboratory at the University of Calgary, demonstrated that the prevalence Figura 1 – Hep2000 cells stained with patient serum containing autoantibodies to GWBs (red). The nuclei are stained with DAPI (blue). Arrows are pointing to different sized GWBs while the arrowhead marks a cell undergoing mitosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,406
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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