The CpG Island in the Murine Foxl2 Proximal Promoter Is Differentially Methylated in Primary and Immortalized Cells
Notice bibliographique
Résumé
Forkhead box L2 (Foxl2), a member of the forkhead transcription factor family, plays important roles in pituitary follicle-stimulating hormone synthesis and in ovarian maintenance and function. Mutations in the human FOXL2 gene cause eyelid malformations and premature ovarian failure. FOXL2/Foxl2 is expressed in pituitary gonadotrope and thyrotrope cells, the perioptic mesenchyme of the developing eyelid, and ovarian granulosa cells. The mechanisms governing this cell-restricted expression have not been described. We mapped the Foxl2 transcriptional start site in immortalized murine gonadotrope-like cells, LβT2, by 5' rapid amplification of cDNA ends and then PCR amplified approximately 1 kb of 5' flanking sequence from murine genomic DNA. When ligated into a reporter plasmid, the proximal promoter conferred luciferase activity in both homologous (LβT2) and, unexpectedly, heterologous (NIH3T3) cells. In silico analyses identified a CpG island in the proximal promoter and 5' untranslated region, suggesting that Foxl2 transcription might be regulated epigenetically. Indeed, pyrosequencing and quantitative analysis of DNA methylation using real-time PCR revealed Foxl2 proximal promoter hypomethylation in homologous compared to some, though not all, heterologous cell lines. The promoter was also hypomethylated in purified murine gonadotropes. In vitro promoter methylation completely silenced reporter activity in heterologous and homologous cells. Collectively, the data suggest that differential proximal promoter DNA methylation may contribute to cell-specific Foxl2 expression in some cellular contexts. However, gonadotrope-specific expression of the gene cannot be explained by promoter hypomethylation alone.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».