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Enregistrement W2008060163 · doi:10.2135/cropsci2008.03.0145

Tagging and Mapping <i>Pse‐1</i> Gene for Resistance to Halo Blight in Common Bean Differential Cultivar UI‐3

2009· article· en· W2008060163 sur OpenAlexaboutno aff
Phillip N. Miklas, Deidré Fourie, Jennifer K. Wagner, R. C. Larsen, Charlotte Mienie

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBulked segregant analysisGermplasmRAPDCultivarPopulationGeneticsPhaseolusPseudomonas syringaeQuantitative trait locusPlant disease resistanceMicrosatelliteGenetic markerMarker-assisted selectionGeneBotanyGene mappingAlleleGenetic diversityChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Halo blight [caused by Pseudomonas syringae pv. phaseolicola (Burkh.) Young et al. ( Psp )] is a serious seed‐borne bacterial disease of common bean ( Phaseolus vulgaris L.). A few resistance (R) genes and quantitative trait loci provide control to one or more races of the pathogen. To better understand monogenic resistance and improve breeding efficiency, we sought to tag and map a gene ( Pse‐1 ) in host differential cultivar UI‐3 (previously named ‘Red Mexican UI‐3’) that provides resistance to races 1, 5, 7, and 9 of Psp Cosegregation for resistance to races 1, 5, 7, and 9, in a recombinant inbred population, ‘Canadian Wonder’/UI‐3 (CU), confirmed the effect of Pse‐1 against multiple races of the pathogen. Bulked‐segregant analysis in the CU population identified six random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers tightly linked (0–3.3 cM) to Pse‐1 . Three of the RAPDs completely linked with Pse‐1 in the CU population were converted to sequence characterized amplified region (SCAR) markers SH11.800, SR13.1150, and ST8.1350. The linked markers were used to integrate Pse‐1 to linkage group B10 of the core map. Allelism tests (F 2 ) confirmed relationships of Pse‐1 and Pse‐4 derived from UI‐3 with R genes in the other host differential cultivars. A survey of advanced lines and cultivars revealed that the SCAR markers generated in this study will have utility for marker‐assisted selection of Pse‐1 in germplasm from the Andean gene pool (e.g., kidney, calima) and from race Mesoamerican within the Middle American gene pool (black, carioca).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,342
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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