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Enregistrement W2008650353 · doi:10.1158/1078-0432.mechres-b32

Abstract B32: Impact of Lipid-Substitution on Assembly and Delivery of siRNA by Cationic Polymers

2012· article· en· W2008650353 sur OpenAlexaff
Hamidreza Montazeri Aliabadi, Hasan Uludağ

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransfectionSmall interfering RNAPolymerChemistryIn vitroBiochemistryCationic polymerizationIn vivoCombinatorial chemistryBiologyGeneOrganic chemistryBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Downregulation of target protein expression by small interfering RNA (siRNA) has been one of the most promising strategies in medicinal therapy since the discovery of this revolutionary process in late 1990s. Many obstacles, however, have to be overcome to achieve safe and efficient siRNA delivery to target cells. Short in vivo half-life of siRNA and safety concerns involved with viral vectors used for DNA transfection are among the main reasons for the necessity of a better delivery system to take full advantage of this strategy. Polycationic polymers have been studied extensively for this purpose and high molecular weight polyethylenimines (PEIs) have led to promising results; however, unacceptable toxicity profile of these polymers has been a hurdle for their clinical application. In this study, we report characterization of a library of polymers synthesized by hydrophobic modification of a low molecular weight (2 kDa) PEI (PEI2) with a wide range of different fatty acids, engineered to enhance their ability to protect and deliver their nucleotide cargo to the cells, while still being water soluble. A general increase in lipid substitution was observed as the lipid:PEI ratio was increased during the synthesis. Among the polymers derived from lipid:PEI ratio of 0.066, caprylic acid-substituted polymer showed a lower binding affinity, while all other polymers performed similarly. Complete siRNA binding was typically achieved at polymer:siRNA ratio of < 0.5. The BC50 (polymer:siRNA ratio needed for 50% binding) was generally increased with the extent of lipid substitution, indicating an adverse effect of lipid substitution on siRNA complexation. Particle size analysis showed a range of 300 to 600 nm for all of the polymer/siRNA complexes, and for all lipid-substituted polymers, a continuous increase in the ζ-potential was observed with increasing polymer:siRNA weight ratio, and all polymers showed positive ζ-potential at the ratio of 10:1. The ζ-potentials of complexes formed with lipid-modified polymers were higher than complexes of PEI2 at all ratios. With the polymer:siRNA ratio of 1:1, all lipid-substituted polymers showed complete protection against degradation, while naked siRNA was readily degraded (<5% intact siRNA remaining) and only ∼68% of siRNA bound with PEI2 remained intact under the experimental conditions. The cytotoxicity of the synthesized polymers was slightly higher than PEI2, but significantly lower than larger MW PEI. Polymer/siRNA complexes formed with lipid-modified polymers increased the cellular uptake of siRNA significantly. Down-regulation of two different target proteins was also evaluated using the modified polymers: a housekeeping enzyme glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), and an efflux protein involved in multi-drug resistance (MDR), P-glycoprotein (P-gp). Optimum silencing for the target proteins was achieved by using polymer:siRNA ratio of 4:1 for GAPDH and 8:1 for P-gp. A maximum of 66% and 67% downregulation was observed for GAPDH and P-gp, respectively. Our results indicate that hydrophobic modification of low molecular PEI could render this otherwise ineffective polymer to a safe effective delivery system for intracellular siRNA delivery and silencing of protein expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,133
Tête enseignante GPT0,489
Écart entre enseignants0,356 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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