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Enregistrement W2009062850 · doi:10.1089/omi.2009.0012

Biomarkers for Prediction of Bovine Respiratory Disease Outcome

2009· article· en· W2009062850 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueOMICS A Journal of Integrative Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMinistry of Agriculture - SaskatchewanUniversity of Saskatchewan
Mots-clésBovine respiratory diseaseHaptoglobinBiologyMetabolomicsDiseaseBiomarkerImmunologyInternal medicineMedicineBioinformaticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fatal bovine respiratory disease (BRD) is frequently the result of a primary viral and a secondary bacterial respiratory infection. In cattle, BRD causes more than half of feedlot deaths and has a major impact on financial losses in the cattle industry in North America. It is, therefore, very important to understand the mechanism of this complex disease process as well to predict and identify BRD susceptible cattle to enhance treatment efficacy. We recently established the value of using combinatorial omics approaches to identify candidate biomarkers associated with stress responses, a factor that can increase the severity of BRD. The objective of the present investigation was to experimentally recreate fatal BRD and to use a combinatorial analysis of proteomic, metabonomic, and elemental profiles in serum samples to determine if multimethod analysis of these biomarkers could predict disease outcome. The proteomic studies revealed that changes in the serum proteome were significant on day 4 postviral infection when compared to preinfection (day 0) serum samples. Proteomic studies identified a group of acute phase proteins (haptoglobin and apolipoprotein AI), which could be linked to a primary viral respiratory infection, but there was no significant association observed with fatal BRD. In contrast, metabonomic and elemental analyses identified candidate biomarkers for viral infection (glucose, LDL, valine, phosphorous, and iron) and disease outcome (lactate, glucose, iron). While multivariate analysis of proteomic and metabolite profiles did not discriminate between animals that survived or died postsynergic viral-bacterial infection by analyzing preinfection (day 0) serum samples, analysis of serum elemental profiles prior to infection was, however, predictive of BRD outcome. Furthermore, discriminant analyses of all three methodologies used to profile serum (collected on day 4 postviral but prior to bacterial infection) revealed differential trends between animals that survived or died following synergic viral-bacterial infection. Thus, a combinatorial approach using proteomic, metabonomic, and elemental analyses of serum samples revealed that multimethod analysis could discriminate between the complex biological responses to secondary bacterial respiratory infection and predict disease outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil0,379

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle