Role of the Hydrogen Bond from Leu722 to the A<sub>1A</sub> Phylloquinone in Photosystem I
Notice bibliographique
Résumé
Photosystem I (PS I) contains two molecules of phylloquinone that function as electron transfer cofactors at highly reducing midpoint potentials. It is therefore surprising that each phylloquinone is hydrogen bonded at the C(4) position to the backbone -NH of a Leu residue since this serves to drive the midpoint potential more oxidizing. To better understand the role of the H-bond, a PS I variant was generated in which L722(PsaA) was replaced with a bulky Trp residue. This change was designed to alter the conformation of the A-jk(1) loop and therefore change the strength of the H-bond to the PsaA-branch phylloquinone. Transient EPR studies at 80 K show that the A(1A) site in the PS I variant is fully occupied with phylloquinone, but the absence of methyl hyperfine couplings in the quinone contribution to the P(700)(*+)A(1)(*-) radical pair spectrum indicates that the H-bond has been weakened. In wild-type PS I, reduction of F(A) and F(B) with sodium dithionite causes a approximately 30% increase in the amplitude of the P(700)(*+)A(1)(*-) transient EPR signal due to the added contribution of the PsaB-branch cofactors to low temperature reversible electron transfer between P(700) and A(1A). In contrast, the same treatment to the L722W(PsaA) variant leads to a approximately 75% reduction in the amplitude of the P(700)(*+)A(1)(*-) transient EPR signal. This behavior suggests that A(1A) has undergone double reduction to phyllohydroquinone, thereby preventing electron transfer past A(0A). The remaining 25% of the P(700)(*+)A(1)(*-) radical pair spectrum shows an altered spin polarization pattern and pronounced methyl hyperfine couplings characteristic of asymmetric H-bonding to the phylloquinone. Numerical simulations of the polarization pattern indicate that it arises primarily from electron transfer between P(700) and A(1B). The altered reduction behavior in the L722W(PsaA) variant suggests that the primary purpose of the H-bond is to tie up the C(4) carbonyl group of phylloquinone in a H-bond so as to prevent protonation and hence lower the probability of double reduction during periods of high light intensity.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».