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Enregistrement W2009379373 · doi:10.1111/j.1537-2995.2005.00170.x

Amino‐acid substitution in the disordered loop of blood group B‐glycosyltransferase enzyme causes weak B phenotype

2005· article· en· W2009379373 sur OpenAlexaff
Mark H. Yazer, Gregory A. Denomme, Natisha L. Rose, Monica M. Palcic

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosyltransferaseEnzymeMutantABO blood group systemMolecular biologyAmino acidBiochemistryEnzyme kineticsBiologyNucleotideChemistryMutationGeneActive siteGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Few studies have investigated the reaction kinetics and interactions with nucleotide donor and acceptor substrates of mutant human ABO glycosyltransferases. Previous work identified a B(w) allele featuring a 556G>A polymorphism giving rise to a weak B phenotype. This polymorphism is predicted to cause a M186V amino-acid mutation within a highly conserved series of 16 amino acids present both in both blood group A- and blood group B-synthesizing enzymes. These residues are known as the disordered loop because their location cannot be determined in the crystal structure of the enzyme. Another patient has been identified with a 556G>A B(w) allele and the kinetics of the resulting mutant glycosyltransferase were studied. STUDY DESIGN AND METHODS: Serologic testing with murine and human reagents, amplification of the coding regions of exons 6 and 7, and DNA sequencing were performed with standard protocols. Enzyme kinetic studies utilized a model of human GTB M186V expressed in Escherichia coli with radiolabeled UDP-galactose and UDP-N-acetylgalactosamine as donor substrates and synthetic H-disaccharide as acceptor following standard protocols. RESULTS: The patient's red blood cells demonstrated a weak, but not mixed-field, B phenotype. Kinetic studies on the mutant enzyme revealed diminished activity (k(cat) = 0.15 per sec with UDP-galactose compared to 5.1 per sec for wild-type GTB) and elevated K(m) values for all substrates. CONCLUSION: This enzyme with a mutation in the disordered loop produces weak B antigen expression because of greatly decreased enzyme activity and reduced affinity for B-donor and acceptor substances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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