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Enregistrement W2009379373 · doi:10.1111/j.1537-2995.2005.00170.x

Amino‐acid substitution in the disordered loop of blood group B‐glycosyltransferase enzyme causes weak B phenotype

2005· article· en· W2009379373 sur OpenAlexaff
Mark H. Yazer, Gregory A. Denomme, Natisha L. Rose, Monica M. Palcic

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlycosyltransferaseEnzymeMutantABO blood group systemMolecular biologyAmino acidBiochemistryEnzyme kineticsBiologyNucleotideChemistryMutationGeneActive siteGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Few studies have investigated the reaction kinetics and interactions with nucleotide donor and acceptor substrates of mutant human ABO glycosyltransferases. Previous work identified a B(w) allele featuring a 556G>A polymorphism giving rise to a weak B phenotype. This polymorphism is predicted to cause a M186V amino-acid mutation within a highly conserved series of 16 amino acids present both in both blood group A- and blood group B-synthesizing enzymes. These residues are known as the disordered loop because their location cannot be determined in the crystal structure of the enzyme. Another patient has been identified with a 556G>A B(w) allele and the kinetics of the resulting mutant glycosyltransferase were studied. STUDY DESIGN AND METHODS: Serologic testing with murine and human reagents, amplification of the coding regions of exons 6 and 7, and DNA sequencing were performed with standard protocols. Enzyme kinetic studies utilized a model of human GTB M186V expressed in Escherichia coli with radiolabeled UDP-galactose and UDP-N-acetylgalactosamine as donor substrates and synthetic H-disaccharide as acceptor following standard protocols. RESULTS: The patient's red blood cells demonstrated a weak, but not mixed-field, B phenotype. Kinetic studies on the mutant enzyme revealed diminished activity (k(cat) = 0.15 per sec with UDP-galactose compared to 5.1 per sec for wild-type GTB) and elevated K(m) values for all substrates. CONCLUSION: This enzyme with a mutation in the disordered loop produces weak B antigen expression because of greatly decreased enzyme activity and reduced affinity for B-donor and acceptor substances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,258
Score d'incertitude au seuil0,787

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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