MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2009425806 · doi:10.1074/jbc.m705424200

Opposing Roles of Syndecan-1 and Syndecan-2 in Polyethyleneimine-mediated Gene Delivery

2008· article· en· W2009425806 sur OpenAlexaff
Sébastien Paris, Alina Burlacu, Yves Durocher

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensNational Research Council CanadaBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSyndecan 1Gene deliveryCell biologyChemistryGeneBiologyGenetic enhancementBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polyethyleneimines (PEIs) are efficient non-viral vectors for gene transfer. Heparan sulfate proteoglycans have been proposed to be the cell-surface receptors for PEI.DNA complexes (polyplexes). Here, we investigated if syndecan-1 (SDC1) and syndecan-2 (SDC2) are involved in PEI-mediated transfection. Following addition of polyplexes to HEK293 cells, green fluorescent protein-tagged SDCs rapidly formed clusters with PEI that were dependent of lipid raft integrity. However, although SDC1 overexpression slightly enhanced PEI-mediated gene expression, SDC2 dramatically inhibited it. Confocal microscopy analysis showed that SDC1.polyplex endocytosis occurred within minutes after addition of polyplexes, whereas SDC2.polyplex endocytosis took hours. Expression of SDC1 cytoplasmic deletion mutants revealed that the SDC1 cytoplasmic tail is required for gene expression, but not for clustering or endocytosis, whereas overexpression of SDC1/SDC2 chimeras showed that the SDC2 ectodomain is responsible for the inhibitory effect on gene transfer. This study provides evidence that SDCs may have opposing effects on PEI-mediated transfection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetRNA Interference and Gene DeliveryTravaux en français237 207