Quantification of Histone Acetyltransferase and Histone Deacetylase Transcripts During Early Bovine Embryo Development1
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian oocytes are very unique cells with an unlimited developmental potential. These totipotent cells are able to remove existing gene-expression patterns and to impose new ones. However, genome reprogramming is still a mystery. Posttranslational modifications by acetylation of the N-termini portion of histones composing the nucleosome are involved in genome reprogramming. These modifications alter the higher-order chromatin structure to render the DNA accessible to the regulatory and transcriptional machinery. In the present study, we have investigated, to our knowledge for the first time, precise expression patterns of seven genes involved in chromatin structure throughout bovine embryo development. Oocytes harvested from bovine ovaries were used for in vitro production of germinal vesicle oocytes, metaphase II oocytes, 2- and 8-cell embryos, and blastocysts. Total RNA was extracted from pools (triplicates) of 20 oocytes or from embryos of each developmental stage. By means of quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction using SYBR Green to detect double-stranded DNA, mRNA expression profiles for histone deacetylases (HDAC1, HDAC2, HDAC3, and HDAC7), histone acetyltransferases (GCN5 and HAT1), and histone H2A were established. Transcripts for all genes were detected at all stages from the oocyte to the blastocyst. The HDAC1, HDAC2 (class I HDAC), and HAT1 (type B HAT) revealed similar expression profiles. The HDAC3 (class I HDAC) tends to have an expression profile similar to those of HDAC1, HDAC2, and HAT1, whereas the HDAC7 (class II HDAC) and GCN5 (type A HAT) profiles were different from those three. These results indicate variable levels of histone deacetylases and histone acetyltransferases throughout embryonic development and may indicate the ones that are involved in somatic remodeling.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle