Inhibition of initiation of reverse transcription in HIV-1 by human APOBEC3F
Notice bibliographique
Résumé
Vif-negative HIV-1 produced in non-permissive human cells incorporate both APOBEC3F (hA3F) AND APOBEC3G (hA3G), and have a severely reduced ability to produce viral DNA in newly infected cells. While it has been proposed that this reduction is due to deamination of deoxycytidine in viral DNA by either hA3G or hA3F, followed by DNA degradation, recent evidence indicates that the inhibition of viral DNA production can occur independently of DNA editing by either hA3F or hA3G. We have reported that the presence of hA3G in Vif-negative HIV-1 produced from either the non-permissive cell line, H9, or from transfected 293T cells transiently or stably expressing hA3G, results in a >or=50% reduction in the ability of primer tRNA(Lys3) to initiate reverse transcription in these virions, and that this is correlated with a similar reduction in the production of early DNA transcripts in the infected cells. In this work, we show that, like hA3G, hA3F in Vif-negative virions also results in a similar reduction in the initiation of reverse transcription in HIV-1, which is correlated with the inhibition of early viral DNA synthesis in the cell, and which does not require cytidine-deamination of DNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».