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Enregistrement W2009925295 · doi:10.1021/bi025819z

Extracellular Domains, Transmembrane Segments, and Intracellular Domains Interact To Determine the Cation Selectivity of Na,K- and Gastric H,K-ATPase

2002· article· en· W2009925295 sur OpenAlexaff
Martin Mense, Vanathy Rajendran, Rhoda Blostein, Michael J. Caplan

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésEctodomainChemistryATP hydrolysisSelectivityATPaseExtracellularTransmembrane domainStereochemistryProtein subunitH(+)-K(+)-Exchanging ATPaseTransmembrane proteinMutantHydrolysisEnzymeBiophysicsBiochemistryMembraneBiologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously reported that three residues of the fourth transmembrane segment (TM4) of the Na,K- and gastric H,K-ATPase alpha-subunits appear to play a major role in the distinct cation selectivities of these pumps [Mense, M., et al. (2000) J. Biol. Chem. 275, 1749-1756]. Substituting these three residues in the Na,K-ATPase sequence with their H,K-ATPase counterparts (L319F, N326Y, T340S) and replacing the TM3-TM4 ectodomain sequence with that of the H,K-ATPase alpha-subunit result in a pump that exhibits 50% of its maximal ATPase activity in the absence of Na(+) when the assay is performed at pH 6.0. This effect is not seen when the ectodomain alone is replaced. To gain more insight into the contributions of the three residues to establishing the selectivity of these pumps for Na(+) ions versus protons, we generated Na,K-ATPase constructs in which these residues are replaced by their H,K-ATPase counterparts either singly or in combinations. Surprisingly, none of the point mutants nor even the triple mutant was able to hydrolyze ATP at pH 6.0 at a rate greater than 20% of their respective V(max)s. For the point mutants L319F and N326Y, protons seem to competitively inhibit ATP hydrolysis at pH 6.0, based on the low apparent affinity for Na(+) ions at pH 6.0 compared to pH 7.5. It would appear, therefore, that the cation selectivity of Na,K- and H,K-ATPase is generated through a cooperative effort between residues of transmembrane segments and the flanking loops that connect these transmembrane domains. This view is further supported by homology modeling of the Na,K-ATPase based on the crystal structure of the SERCA pump.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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