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Enregistrement W2010547190 · doi:10.1021/bi602425c

Intrinsic Fluorescence Reports a Global Conformational Change in the N-Lobe of Human Serum Transferrin following Iron Release†

2007· article· en· W2010547190 sur OpenAlexaff
Nicholas G. James, Christopher L. Berger, Shaina L. Byrne, Valerie C. Smith, Ross T. A. MacGillivray, Anne B. Mason

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésChemistryFluorescenceReaction rate constantTransferrinMutantTryptophanConformational changeAbsorbanceBiophysicsKineticsBiochemistryStereochemistryCrystallographyChromatographyBiologyAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transferrins have been extensively studied in order to understand how they reversibly bind and release iron. Human serum transferrin (hTF) is a single polypeptide chain that folds into two lobes (N- and C-lobe); each lobe binds a single ferric ion. Iron release induces a large conformational change in each lobe. At the putative endosomal pH of 5.6, measurement of the increase in intrinsic fluorescence upon iron release from the recombinant N-lobe yields two rate constants: 8.9 min-1 and 1.3 min-1. Direct monitoring of iron release from the N-lobe at pH 5.6 (by the decrease in absorbance at 470 nm) gives a single rate constant of 9.1 min-1, definitively establishing that the faster rate constant in the fluorescent studies is due to iron release. To further elucidate the molecular basis of the intrinsic fluorescence change (and the source of the slower rate constant), we examined the contributions of the three individual tryptophan residues in the N-lobe (Trp8, Trp128, and Trp264). Three double mutants, each containing the single remaining tryptophan residue, were produced. In the iron-bound N-lobe, Trp128 and Trp264 are quenched by iron and account for almost the entire fluorescent signal when iron is released. As for the wild-type N-lobe, the fluorescence increase for each of these mutants is best fit by a double-exponential function indicating two processes. Trp8 is severely quenched under all conditions, making virtually no contribution to the signal. Additionally, a mutant lacking all three Trp residues allows assignment of the fluorescent signal completely to the three tryptophan residues and observation of the presence of one (or more) tyrosinates in the N-lobe that have physiological significance in the uptake of iron.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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