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Enregistrement W2010857804 · doi:10.1139/o04-131

Intermediate studies on refolding of arginine kinase denatured by guanidine hydrochloride

2005· article· en· W2010857804 sur OpenAlexvenueno aff
Hongmin Tang, Hong Yu

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésGuanidineChemistryCircular dichroismFluorescenceHydrochlorideArginine kinaseMolten globuleProtein secondary structureProtein foldingNative stateCrystallographyArginineFolding (DSP implementation)Protein tertiary structureStereochemistryAmino acidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The refolding course and intermediate of guanidine hydrochloride (GuHCl)-denatured arginine kinase (AK) were studied in terms of enzymatic activity, intrinsic fluorescence, 1-anilino-8-naphthalenesulfonte (ANS) fluorescence, and far-UV circular dichroism (CD). During AK refolding, the fluorescence intensity increased with a significantly blue shift of the emission maximum. The molar ellipticity of CD increased to close to that of native AK, as compared with the fully unfolded AK. In the AK refolding process, 2 refolding intermediates were observed at the concentration ranges of 0.8-1.0 mol/L and 0.3-0.5 mol GuHCl/L. The peak position of the fluorescence emission and the secondary structure of these conformation states remained roughly unchanged. The tryptophan fluorescence intensity increased a little. However, the ANS fluorescence intensity significantly increased, as compared with both the native and the fully unfolded states. The first refolding intermediate at the range of 0.8-1.0 mol GuHCl/L concentration represented a typical "pre-molten globule state structure" with inactivity. The second one, at the range of 0.3-0.5 mol GuHCl/L concentration, shared many structural characteristics of native AK, including its secondary and tertiary structure, and regained its catalytic function, although its activity was lower than that of native AK. The present results suggest that during the refolding of GuHCl-denatured AK there are at least 2 refolding intermediates; as well, the results provide direct evidence for the hierarchical mechanism of protein folding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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