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Enregistrement W2010881438 · doi:10.1182/blood-2005-09-3613

Impaired class switch recombination (CSR) in Waldenstrom macroglobulinemia (WM) despite apparently normal CSR machinery

2005· article· en· W2010881438 sur OpenAlexaff
Jitra Kriangkum, Brian J. Taylor, Erin Strachan, Michael J. Mant, Tony Reiman, Andrew R. Belch, Linda M. Pilarski

Notice bibliographique

RevueBlood · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Lymphocytic Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunoglobulin class switchingBiologyWaldenstrom macroglobulinemiaCytidine deaminaseB cellIsotypeMolecular biologyMacroglobulinemiaSomatic hypermutationMonoclonal gammopathy of undetermined significanceImmunologyAntibodyMonoclonalMonoclonal antibodyMultiple myelomaLymphoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Analysis of clonotypic isotype class switching (CSR) in Waldenström macroglobulinemia (WM) and IgM monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) reveals a normal initial phase of B-cell activation as determined by constitutive and inducible expression of activation-induced cytidine deaminase (AID). Switch mu (Smu) analysis shows that large deletions are not common in WM or IgM MGUS. In CD40L/IL-4-stimulated WM cultures from 2 patients, we observed clonotypic IgG exhibiting intraclonal homogeneity associated with multiple hybrid Smu/Sgamma junctions. This suggests CSR had occurred within WM cells. Nevertheless, the estimated IgG/IgM-cell frequency was relatively low (1/1600 cells). Thus, for the majority of WM B cells, CSR does not occur even when stimulated in vitro, suggesting that the WM cell is constitutively unable to or being prevented from carrying out CSR. In contrast to WM, the majority of IgM MGUS clones exhibit intraclonal heterogeneity of IgH VDJ. Furthermore, most IgM MGUS accumulate more mutations in the upstream Smu region than do WM, making them unlikely WM progenitors. These observations suggest that switch sequence analysis may identify the subset of patients with IgM MGUS who are at risk of progression to WM.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,423
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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