Large‐scale plasmid DNA processing: evidence that cell harvesting and storage methods affect yield of supercoiled plasmid DNA
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The effect of bacterial-cell centrifugation and handling on the initial stages of plasmid processing was investigated. Escherichia coli cells containing either a 6 or 20 kb plasmid were grown in 75- and 450-litre bioreactors, and the process yield of the early recovery stages was characterized in terms of SC pDNA (supercoiled plasmid DNA) recovered. In all cases, the cells were totally recovered using either a continuous-feed, intermittent-solids-discharge, disc-stack centrifuge or a continuous-feed, batch-discharge, solid-bowl centrifuge. The cells were then either processed immediately or stored frozen. The centrifugation method considerably affected the yield of SC pDNA, and there was evidence that the intermittent discharge of cells from a centrifuge operating at high speed led to a sediment containing lysed cells and degraded pDNA. This led to estimated plasmid yield losses of up to 40% as compared with cells recovered from laboratory or solid-bowl centrifuges, where there is evidently no cell stress on discharge. By inference, the cell stress on feed to either of the continuous centrifuges studied was not implicated in product loss. Freezing of the recovered cells gives a convenient hold stage prior to further processing. In all cases, this extra freeze-thaw stage led to loss of SC pDNA, and this was in addition to the loss attributed to cell lysis during centrifugation discharge. Only average yields can be gained from pilot plant-scale studies; separate laboratory-based experiments indicated that this loss of SC pDNA is determined by the time and temperature for which the resuspended cells are held.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle