Lysine acetylation: enzymes, bromodomains and links to different diseases
Notice bibliographique
Résumé
Lysine acetylation refers to transfer of the acetyl moiety from acetyl-CoA to the ε-amino group of a lysine residue on a protein. This has recently emerged as a major covalent modification and interplays with other modifications, such as phosphorylation, methylation, ubiquitination (addition of a small protein called ubiquitin) and SUMOylation [addition of a ubiquitin-like protein known as SUMO (small ubiquitin-related modifier)], to form multisite modification programmes for cellular regulation in diverse organisms. This modification is post-translational (i.e. after synthesis of a protein) and reversible, with its level being dynamically balanced by two groups of enzymes known as lysine acetyltransferases and deacetylases. The acetyltransferases belong to three major families, whereas deacetylases have been divided into the classical and sirtuin [Sir-tu-in, for Sir2 (silent information regulator 2)-like protein; named after the yeast protein Sir2] families. In addition to these enzymes, proteins containing the bromodomain, a protein module named after the fly protein Brahma (God of creation in Hindu), are relevant to lysine acetylation biology due to their ability to recognize acetyl-lysine-containing peptides. Importantly, recent studies have made intimate links between these three different groups of proteins to different pathological conditions. In this chapter, we provide a brief overview of these proteins and emphasize their direct links to related human diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».